数据集概述
本数据集为“有颌脊椎动物进化初期核酸传感器形成”研究的支持信息,包含序列比对和系统发育分析两类核心数据,覆盖PKR相关蛋白、eif2α激酶等分子的系统发育关系及多类群PKR的序列比对结果,助力相关进化机制研究。
文件详解
该数据集包含两个核心目录,均为TXT格式文件,具体说明如下:
- Data for alignment/ 目录(序列比对数据):
- 文件示例: Alignment3_figure1(E). The phylogenetic relationship of PKR-related proteins-hj2KN7.txt
- 文件格式: TXT(.txt)
- 内容说明: 包含PKR同源蛋白激酶域序列、dsRBD含蛋白等大规模比对数据,以及灵长类、啮齿类等15类群PKR的序列比对结果,与研究图表(Figure1、Figure2、FigureS3)对应。
- Data for phylogeny/ 目录(系统发育分析数据):
- 文件示例: Phylogeny7_figureS3(I). Phylogenetic relationship of PKR_Lepidosauria.txt
- 文件格式: TXT(.txt)
- 内容说明: 涵盖PKR相关蛋白、eif2α激酶的系统发育关系,以及15类群PKR的系统发育分析结果,与研究图表(Figure1、Figure2、FigureS3)对应。
适用场景
- 进化生物学研究: 分析有颌脊椎动物初期核酸传感器相关分子的进化起源与分化机制
- 分子生物学研究: 探究PKR家族蛋白、eif2α激酶等分子的序列特征与功能关联性
- 系统发育分析: 验证或扩展核酸传感器相关蛋白的系统发育关系模型
- 比较基因组学研究: 对比不同脊椎动物类群(如软骨鱼、硬骨鱼、哺乳类)的核酸传感器分子进化差异