数据集概述
本数据集为海洋浮游桡足类群落结构宏遗传研究的相关数据，包含人工群落与野外样本的分析结果，涉及MOTU聚类阈值优化、序列读数与生物量关联验证、分类学分析等内容，支持浮游桡足类群落结构的快速评估研究，共含8个文件。
文件详解
- 文件名称：MID_tag_information.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：MID标签相关信息，用于区分不同样本或测序数据的标识信息
- 文件名称：Morphological_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：浮游桡足类群落的形态学分析数据，包含物种鉴定、生物量等形态学观察结果
- 文件名称：Taxonomy file for classification.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：用于分类学分析的参考文件，包含分类层级、物种信息等分类学数据
- 文件名称：Sequence file for classification.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：分类用序列文件，包含如Chaetopterus_variopedatus等物种的核糖体DNA序列信息
- 文件名称：JH_copepod_LSU_aligned.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：桡足类核大亚基核糖体DNA（LSU）的比对序列文件
- 文件名称：Field_MOTU_list.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：野外样本的分子操作分类单元（MOTU）列表数据
- 文件名称：99% sequence reads.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：基于99%相似性阈值聚类的序列读数数据
- 文件名称：33sp_MOTU_list.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：含33个形态学鉴定物种的人工群落的MOTU列表数据
数据来源
论文“A metagenetic approach for revealing community structure of marine planktonic copepods”
适用场景
- 浮游桡足类群落结构分析: 利用宏遗传数据与形态学数据的对应关系，研究海洋浮游桡足类的群落组成与结构特征
- MOTU聚类阈值优化研究: 分析不同相似性阈值（97%、99%）对浮游桡足类MOTU聚类结果的影响，优化物种鉴定分辨率
- 序列读数与生物量关联验证: 验证序列读数作为生物量 proxy 的可行性，探索宏遗传数据定量分析方法
- 分类学方法应用: 基于核糖体DNA序列数据，开展浮游桡足类的分类学鉴定与系统发育研究
- 海洋生态监测: 利用宏遗传方法快速评估海洋环境中浮游桡足类群落结构，支持海洋生态监测与评估工作
