数据集概述
本数据集包含复现《Nature Communications》发表的“鱼类-无脊椎动物共生关系中通过共生途径驯化”研究分析所需的全部数据与R代码，涵盖10个子数据集及对应的分析脚本与输出文档。
文件详解
- 数据文件（CSV格式，共11个）：
- CBC2018_PairedChoice_data.csv：配对选择实验数据，含日期、时间、测试者、刺激/对照选择等字段
- CBC2018_FishBodyCondition_data.csv：长鳍雀鲷身体状况数据
- CBC2018_SwarmCount_data.csv：糠虾群密度估算数据
- CBC2018_SiteFidelity_All_data.csv：位点忠诚度相关数据
- CBC2018_Observations_data.csv：定时观察数据，含雀鲷攻击行为、追逐事件等字段
- CBC2018_Transects_data.csv：样带调查数据
- 其他CSV文件：对应养殖场普查、捕食实验1-2、养殖场藻类组成、糠虾排泄物与营养可获得性等数据集
- 分析脚本：
- Brooker_et_al_RMarkdown_Domestication.Rmd：R Markdown文件，包含所有变量描述及10个数据集的分析代码
- 输出文档：
- PDF版本的R Markdown输出：包含代码运行结果的完整文档
适用场景
- 共生关系研究：分析鱼类-无脊椎动物共生系统中驯化现象的机制
- 行为生态学研究：探究动物行为（如选择偏好、捕食防御）与环境因子的关联
- 数据复现与验证：复现Nature Communications发表研究的分析过程与结果
- 生态数据分析方法参考：学习R语言在生态数据处理与统计分析中的应用
- 营养生态学研究：研究生物排泄物对环境营养可获得性的影响机制
