数据集概述
本数据集包含5个表格文件,对应论文“Disruption of H3K4me3-Lactate Axis in Obese Macrophages Impairs Efferocytosis and Wound Repair”的补充数据。内容围绕肥胖巨噬细胞中H3K4me3修饰与乳酸代谢轴的异常展开,涵盖缺氧诱导的表观遗传变化、基因集富集分析、不同饮食条件下的RNA测序差异表达等实验结果,用于支撑巨噬细胞功能损伤机制的研究。
文件详解
- Table1_DP_ND_hypoxia-induced_H3K4me3.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录缺氧诱导下肥胖(DP)与正常(ND)巨噬细胞中H3K4me3修饰相关的实验数据
- Table2_ND_hypo-induced_MsigDB.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含正常巨噬细胞缺氧诱导后的MsigDB基因集富集分析结果
- Table3_RNA-PLX145991_volcano_plot_v2_Low_Fat_Diet_1h_vs_Low_Fat_Diet_Basal.xlsm
- 文件格式:XLSM
- 字段映射介绍:呈现低脂饮食条件下,PLX145991处理1小时与基础状态的RNA测序差异表达火山图数据
- Table4_RNA-PLX145991_volcano_plot_v2_High_Fat_Diet_1h_vs_High_Fat_Diet_Basal.xlsm
- 文件格式:XLSM
- 字段映射介绍:呈现高脂饮食条件下,PLX145991处理1小时与基础状态的RNA测序差异表达火山图数据
- Table5_Science_Batie_peaklist.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Science论文相关的Batie peaklist数据(具体内容未预览)
数据来源
Zenodo(DOI: 10.5281/zenodo.16368066)
适用场景
- 肥胖相关巨噬细胞表观遗传研究: 分析H3K4me3修饰在肥胖巨噬细胞中的异常变化及其调控机制
- 代谢轴与免疫功能关联分析: 探究H3K4me3-乳酸代谢轴对巨噬细胞吞噬(Efferocytosis)功能的影响
- 药物干预效果评估: 基于PLX145991处理后的RNA测序数据,研究药物对不同饮食条件下巨噬细胞基因表达的调控作用
- 伤口修复机制研究: 结合巨噬细胞功能损伤数据,解析肥胖状态下伤口愈合延迟的分子机制
- 基因集富集分析: 利用MsigDB数据挖掘巨噬细胞缺氧响应的关键信号通路