数据集概述
本数据集包含来自红海两种常见造礁珊瑚(爱德华氏角蜂巢珊瑚和黄滨珊瑚)骨骼中的75个内生菌细菌宏基因组组装基因组(MAGs),旨在为研究珊瑚内生微生物组的功能潜力、能量供应机制及珊瑚白化过程中的作用提供基础数据。
文件详解
- 元数据文件
- 文件名称:Zenodo_Coral_Endolith_MAGs_metadata_20211028.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:预计包含75个内生菌MAGs的关联元数据,可能涉及样本来源(珊瑚种类、红海采样信息)、基因组组装基础信息等(注:无预览,基于命名推断)
- 基因组数据压缩包
- 文件名称:Zenodo_Coral_Endolith_MAGs_20211028.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内预计包含75个内生菌细菌宏基因组组装基因组(MAGs)的序列文件及相关注释文件(注:无预览,基于标题推断)
数据来源
Zenodo平台(基于文件名推断)
适用场景
- 珊瑚共生微生物组功能研究:分析内生菌基因组的代谢通路,探究其为珊瑚宿主供能及参与共生体 nutrient cycling的机制
- 珊瑚白化应对机制研究:通过基因组数据挖掘内生菌在珊瑚失去虫黄藻后维持宿主能量供应的潜在功能
- 红海珊瑚特有微生物资源开发:识别红海造礁珊瑚内生菌的特有基因或代谢特征
- 珊瑚健康监测生物标志物筛选:基于内生菌基因组特征开发指示珊瑚健康状态的分子标记
- 微生物组-珊瑚共生关系建模:结合基因组数据构建内生菌与珊瑚宿主的共生互作网络模型