数据集概述
该数据集包含TCGA癌症患者对化疗药物的反应数据,整合了TCGA的临床数据、癌症组织基因表达数据及TCIA的肿瘤免疫组数据,涵盖结直肠癌(CRC)和肺癌的5种常见化疗药物,其中FOLFOX组合疗法为基于单药治疗时间推导的新型数据集。
文件详解
- 单药数据集文件(CSV格式):
- crc_folfox_cleaned.csv:结直肠癌FOLFOX疗法数据,字段包括case_id、days_to_birth、treatment_best_response等临床与治疗反应信息
- crc_oxali_cleaned.csv:结直肠癌奥沙利铂疗法数据,字段与FOLFOX文件一致
- crc_5fu_cleaned.csv:结直肠癌5-氟尿嘧啶疗法数据,字段与上述CRC文件一致
- lung_carboplatin_cleaned.csv:肺癌卡铂疗法数据,字段与CRC文件一致
- lung_cisplatin_cleaned.csv:肺癌顺铂疗法数据,字段与CRC文件一致
- 压缩包文件:
- all_csv.zip:包含所有CSV格式单药数据集的压缩文件
数据来源
Zenodo(基于TCGA Research Network和TCIA.at数据库数据)
适用场景
- 肿瘤学研究:分析不同化疗药物对结直肠癌、肺癌患者的疗效差异
- 生物信息学分析:探究基因表达、免疫组特征与化疗反应的关联
- 临床治疗优化:为结直肠癌FOLFOX一线治疗方案的效果评估提供数据支持
- 药物研发辅助:识别化疗反应相关生物标志物,助力个性化治疗研究