数据集概述
本数据集围绕真兽类配子识别基因（Zan）的快速分化展开，包含17个真兽目112个物种的基因序列及系统发育树文件，用于探究Zan基因在物种分化和真兽类适应性辐射中的作用。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre格式，共40个）：
- 示例文件：Zan.con.tre、izumo1.nex.con.tre、adam2.nex.con.tre等
- 内容：基于贝叶斯方法构建的基因系统发育树，对应不同基因（如Zan、Adam2、Prdm9、Cytb等）的物种进化关系
- 序列比对文件（.phy格式，共36个）：
- 示例文件：wbp2nl.phy、crisp2.phy、prdm9.phy等
- 内容：使用T-coffee软件Meta-coffee模式生成的核苷酸序列比对文件
- 文档文件（.docx格式，共2个）：
- TableS1_accessionIDs.docx：包含各核苷酸序列的GenBank或Ensembl登录号
- jmodeltest.docx：可能为模型测试相关文档
- 其他文件：
- README_file.txt：数据集说明文档
- SI_Gene_Acc_Table.pdf：补充信息中的基因登录号表格
- zan_spliced.nexus：Zan基因剪接相关的Nexus格式文件
- mgam.fas、cytb.fas：Fasta格式的基因序列文件
适用场景
- 进化生物学研究：分析真兽类物种分化与配子识别基因的关系
- 系统发育分析：利用Zan基因序列构建高精度的真兽类系统发育树
- 生殖隔离机制研究：探究Zan基因功能分化在合子前生殖隔离中的作用
- 分子进化分析：研究正选择和结构域重复对基因进化速率的影响
- 比较基因组学：对比不同基因（如Zan与Cytb、Prdm9）的系统发育解析能力
