数据集概述
本数据集包含研究脂肪酶补充剂对野生型小鼠胃肠道环境影响的16S rRNA测序数据、清单文件及元数据,涉及长期和短期实验中粪便与盲肠样本,为分析肠道菌群变化提供基础数据。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下:
- 清单文件目录(Manifest files/):
- Manifest_Long-term-study_Feces:长期实验粪便样本清单(无扩展名)
- Manifest_Long-term-study_Cecum:长期实验盲肠样本清单(无扩展名)
- Manifest_Short-term-study_Cecum:短期实验盲肠样本清单(无扩展名)
- 元数据目录(Metadata/):
- Metadata.xlsx:Excel格式元数据文件,包含实验样本的描述信息
- 16S rRNA基因测序目录(16S rRNA gene sequencing/):
- 长期实验粪便样本子目录(Long-term Study Feces/):包含多个.gz格式的测序原始数据文件(如15M-A-JA-18-0835_S7_L001_R2_001.fastq.gz)
- 长期实验盲肠样本子目录(Long-term Study Cecum/):包含多个.gz格式的测序原始数据文件(如A-JA-18-0823-C_S46_L001_R2_001.fastq.gz)
- 短期实验盲肠样本子目录(Short-term Study Cecum/):包含多个.gz格式的测序原始数据文件(如A-JA-19-0049-C_S54_L001_R2_001.fastq.gz)
适用场景
- 肠道微生物组研究:分析脂肪酶补充剂对小鼠肠道菌群结构的影响
- 营养学研究:探究外源酶补充剂对动物胃肠道微生态的调控机制
- 微生物生态学分析:比较长期与短期实验中粪便、盲肠样本的菌群差异
- 代谢组学关联研究:结合肠道菌群数据研究宿主代谢变化