数据集概述
本数据集为论文《植物稳定细胞重编程的合成记忆电路》的配套支持数据,包含实验原始数据、统计结果、绘图代码、质粒信息表及引物表格等多类型文件,覆盖DNA组件、实验测试数据、图表关联信息等核心内容,为植物合成生物学相关研究提供完整数据支撑。
文件详解
- 数据压缩包:
- Data_values.zip:压缩包格式,可能包含实验数据值文件
- Plasmids_gb.zip:压缩包格式,可能包含质粒的GenBank格式文件
- Plasmids.zip:压缩包格式,可能包含质粒相关数据文件
- 代码文件:
- Plots_for_Plant_BLADE_paper_0.1.2.R:R语言格式,用于论文图表绘制的代码
- Code_for_Plots_and_stats_0.1.0.R:R语言格式,用于图表绘制和统计分析的代码
- 文本文件:
- DNA_components_list.txt:文本格式,DNA组件列表
- Figs_with_raw_data.txt:文本格式,记录图表(Fig 1-5及补充图表1-4)与原始数据的关联
- Raw_data_Values_PROtest_TCTP_Act2_s35S.txt:文本格式,PROtest实验的TCTP、Act2、s35S原始数据值
- Stats_results.txt:文本格式,统计分析结果
- 表格文件:
- Table_Plasmids_Publication.tsv:TSV格式,包含质粒信息(字段示例:Unique_ID、LLP_ID、Lab_name、Fig_label_in_paper等)
- Table_Primers.xlsx:Excel格式,引物信息表格
适用场景
- 植物合成生物学研究:分析合成记忆电路对植物细胞重编程的作用机制
- 分子生物学实验验证:基于质粒、引物数据复现或扩展相关实验
- 生物信息学分析:利用原始数据和统计代码开展植物基因表达调控研究
- 学术论文辅助:为植物合成记忆电路相关论文撰写提供数据参考与图表绘制支持