数据集概述
本数据集围绕植物Campanula americana的自交能力与漂变负荷随分布范围扩张的演化展开，包含RADseq测序数据处理文件、遗传多样性分析脚本、表型数据及相关说明文档，用于验证分布范围扩张过程中奠基者效应、有效种群大小变化对自交能力和有害突变积累的影响。
文件详解
- 数据处理文件
- 文件名称：bellmerge.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：RADseq测序数据处理后的变异位点数据，包含种群遗传变异信息
- 文件名称：ipyrad params.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：ipyrad软件处理RADseq数据的参数配置文件，记录组装名称等关键参数
- 分析脚本文件
- 文件名称：diversity.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：提取种群突变参数和Tajima's D的分析脚本
- 文件名称：inbreeding coefficient.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：计算近交系数的分析脚本
- 文件名称：TDoA.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：相关表型或遗传分析的脚本文件
- 表型数据文件
- 文件名称：Koskietal_EvoLett_PhenotypicData_DriftLoad_InbreedingDepression.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含表型数据、漂变负荷及近交衰退相关数据的表格文件
- 说明文档
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，解释各文件用途及RADseq数据分析方法
数据来源
论文“Selfing ability and drift load evolve with range expansion”
适用场景
- 植物种群遗传学研究：分析分布范围扩张对植物种群遗传多样性、有效种群大小的影响
- 自交演化机制研究：探讨奠基者效应下自交能力的演化规律及其与有害突变积累的关系
- 漂变负荷与近交衰退分析：验证分布范围扩张过程中漂变负荷的积累模式及近交衰退的地理格局
- 生物地理学与演化关联研究：结合遗传数据与地理分布，解析历史扩张事件对植物交配系统演化的遗留影响
