中华角蛙的系统地理学与种群动态模型数据

数据集概述

本数据集围绕非洲泡沫巢树蛙(Chiromantis rufescens)展开,通过系统发育地理推断和种群统计模型测试,分析其在西非和中非几内亚-刚果雨林中的分化模式。包含线粒体DNA、单核苷酸多态性数据及种群分化模型测试结果,涉及130个样本,共6个文件。

文件详解

  • 基因序列与结构文件
  • 文件名称:16s.nex
  • 文件格式:NEX
  • 字段映射介绍:包含16S线粒体DNA基因序列数据,用于种群系统发育分析
  • 文件名称:chiro121_7326.str
  • 文件格式:STR
  • 字段映射介绍:种群结构分析相关数据,记录样本的单核苷酸多态性(SNP)标记信息
  • 元数据与配置文件
  • 文件名称:chiro.xmlrufi.xml
  • 文件格式:XML
  • 字段映射介绍:数据集元数据文件,包含样本信息、实验参数及分析配置说明
  • 统计分析结果文件
  • 文件名称:geographicSFS.zipphylogeneticSFS.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内含地理分布频谱(SFS)和系统发育频谱数据,用于种群分化模型测试与基因流分析

数据来源

论文“Exploring rainforest diversification using demographic model testing in the African foam-nest treefrog (Chiromantis rufescens)”

适用场景

  • 雨林生物多样性研究:分析几内亚-刚果雨林物种的地理分化模式与森林避难所效应
  • 种群遗传学研究:通过线粒体DNA和SNP数据解析树蛙种群结构与遗传多样性
  • 生物地理模型验证:测试种群分化模型(如基因流、种群大小变化、隔离与二次接触)
  • 气候变化与物种分布研究:结合物种分布模型识别气候稳定区,探讨冰期避难所对物种分化的影响
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数据与资源

该数据集没有数据

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2026年2月9日
创建于 2026年2月9日
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