数据集概述
该数据集为鼻咽癌研究提供多组学数据支持，包含患者的种系SNP基因型、体细胞突变、基因表达原始计数及TPM值，所有文件均标注患者ID及鼻咽癌亚型信息，可用于分析肿瘤免疫微环境与不同鼻咽癌表型进展轨迹的关联。
文件详解
- 基因型数据文件（PLINK格式）：
- plink_NCCS.bed、plink_NCCS.bim、plink_NCCS.fam：PLINK格式文件，存储所有患者的种系SNP基因型数据，文件中包含PatientID_subtype格式的患者及亚型标注
- 体细胞突变数据文件：
- somatic_mutations_maf.tsv：TSV格式文件，列出所有患者检测到的体细胞突变，字段包含variantID、Hugo_Symbol、染色体位置等突变信息
- 基因表达数据文件：
- raw_gene_expression_counts.tsv：TSV格式文件，存储所有患者的基因表达原始计数数据
- gene_expression_tpm.tsv：TSV格式文件，存储所有患者的基因表达TPM标准化数据
适用场景
- 肿瘤免疫学研究：分析肿瘤免疫微环境特征与鼻咽癌进展的关联
- 鼻咽癌分子分型研究：基于多组学数据识别不同鼻咽癌表型的分子标志物
- 肿瘤基因组学分析：探究种系SNP、体细胞突变与鼻咽癌发生发展的关系
- 基因表达谱分析：研究关键基因表达水平对鼻咽癌亚型及进展的影响
