数据集概述
本数据集包含中美洲热带雨林近期局域超级多样化研究相关的系统发育树文件、多样化分析脚本及输入数据，支持复现研究中的谱系时间树（LTT）图和地史物种形成-灭绝分析（GeoSSE）等结果，为相关演化研究提供数据基础。
文件详解
该数据集包含7个独立文件，具体说明如下：
- 系统发育树文件（.tre格式，共4个）：
- BI.tre：贝叶斯推断得到的系统发育树文件
- ASTRAL.tre：ASTRAL方法构建的系统发育树文件
- ML_branch_lengths.tre：带分支长度的最大似然法系统发育树文件
- ML_calibrated.tre：经时间校准的最大似然法系统发育树文件
- 格式说明：均为Nexus格式，可通过FigTree等软件可视化
- 压缩文件（.zip格式，共2个）：
- R_diversification_input.zip：复现多样化分析所需的输入数据压缩包
- R_diversification_scripts.zip：复现多样化分析（LTT图、GeoSSE）的R语言脚本压缩包
- 图片文件（.png格式，共1个）：
- FigS1.11.png：研究中的补充图表文件
适用场景
- 生物多样性研究：分析中美洲热带雨林物种近期超级多样化的演化模式
- 系统发育分析：验证不同方法构建的中美洲雨林物种系统发育树拓扑结构
- 演化模型验证：复现并扩展地史物种形成-灭绝（GeoSSE）等多样化分析
- 生态演化教学：作为系统发育树可视化与多样化分析的实践案例数据
