数据集概述
本数据集来自发表于PLOS Genetics的研究论文，聚焦昼夜节律对巨噬细胞吞噬淀粉样蛋白β（Aβ）聚集体的调控机制，包含吞噬实验的荧光图像、像素强度数据，以及液相色谱串联质谱的原始与标准化数据，为阿尔茨海默病相关昼夜节律研究提供支撑。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下：
- 核心实验数据文件：
- LCMSMS_HSPGs_CSPGs_in macrophages.xlsx：巨噬细胞中硫酸乙酰肝素蛋白聚糖（HSPGs）和硫酸软骨素蛋白聚糖（CSPGs）的液相色谱串联质谱数据文件，格式为Excel。
- 淀粉样蛋白β吞噬实验数据（按亚型分类）：
- Amyloid-beta (1-40) phagocytosis目录：
- ab40phagocytosis_raw data from image analysis script.csv：Aβ(1-40)吞噬实验原始数据，CSV格式，含Time、Replicate、Average、Area、Max等字段。
- IQRoutliersremoved_AB40phagocytosis_analyzeddata.csv：去除异常值后的Aβ(1-40)吞噬分析数据，CSV格式。
- Image Files子目录：含zt20_AB40_REP1_3.lsm等荧光显微镜图像文件，格式为LSM。
- Amyloid-beta (1-42) phagocytosis目录：
- raw ab42 phagocytosis data from image analysis script.csv：Aβ(1-42)吞噬实验原始数据，CSV格式。
- IQRoutliers removed_analysed_AB42phagocytosis.csv：去除异常值后的Aβ(1-42)吞噬分析数据，CSV格式。
- Image Files子目录：含zt16_replicate1_image7.lsm等荧光显微镜图像文件，格式为LSM。
- Amyloid-beta (1-42) phagocytosis in Knockout cells目录：
- raw ab42 phagocytosis data using per1_per2 knockout cells_from image analysis script.csv：PER1-/-/PER2-/-敲除细胞中Aβ(1-42)吞噬原始数据，CSV格式。
- IQRoutliersremoved_analyzed_ab42 phagocytosis in per1_per2 knockout cells.csv：去除异常值后的敲除细胞吞噬分析数据，CSV格式。
- Image Files子目录：含zt16_rep1_2.lsm等荧光显微镜图像文件，格式为LSM。
- 肝素酶处理实验数据目录（如Amyloid-beta (1-42) phagocytosis with heparinase I等）：
- 含ab42phagocytosiswithhep1_fromimageanalysisscript_raw.csv等原始数据文件及对应的分析数据文件，CSV格式；Image Files子目录含相关LSM格式荧光图像。
- mouse amyloid-beta (1-42) phagocytosis目录：
- 含raw mouseAB42 phagocytosis data from image analysis script.csv等原始数据文件、分析数据文件及LSM格式荧光图像文件。
数据来源
PLOS Genetics发表的研究论文《Circadian Control of Heparan Sulfate Levels Times Phagocytosis of Amyloid Beta Aggregates》
适用场景
- 阿尔茨海默病病理机制研究：分析昼夜节律对Aβ吞噬的调控作用。
- 昼夜节律生物学研究：探究硫酸乙酰肝素水平的昼夜振荡规律。
- 药物靶点筛选：评估肝素酶对Aβ吞噬节律的影响，寻找潜在干预靶点。
- 神经免疫学研究：研究巨噬细胞对不同Aβ亚型的吞噬特性差异。
