自然细菌群落生态演替的群落水平特征数据集

数据集概述

本数据集包含自然细菌群落生态演替相关的输入数据和补充结果,支持复现相关研究中细菌群落功能测量、样本元数据及生态模型分析结果,为细菌群落演替的群落水平特征研究提供数据基础。

文件详解

  • 输入数据文件:
  • 20151016_Functions_remainder.csv:CSV格式,含样本ID、重复样本、培养板等信息,及7天实验期CO2、细胞计数、酶活性等功能指标(如mgCO2.7、CPM7、mG7等)
  • samples_metadata_time0.tsv:TSV格式,含样本ID、采样日期、最优采样位点及多种算法的样本分组结果(如Part.SparCC.PAM.t0、Part.SJD.PAM.t0等)
  • Dist_GPS-Haversine.dat:样本间的空间距离数据文件
  • corMat-SparCC_20151016_OTU_remainder.clean.samples.txt:SparCC算法计算的样本相关性矩阵文件
  • distMat_ShannonJensen_Samples_Time0.clean.dat:Jensen-Shannon散度计算的样本距离矩阵文件
  • 补充结果文件:
  • SEMmodels.zip:结构方程模型分析结果压缩包
  • TaxaSummaries.zip:细菌分类单元相对丰度数据压缩包,含不同分类水平矩阵及交互式可视化HTML文件

适用场景

  • 微生物生态学研究:分析自然细菌群落的生态演替规律
  • 群落功能分析:探究细菌群落功能指标与演替阶段的关联
  • 生物信息学建模:验证细菌群落结构与功能的预测模型
  • 微生物数据可视化:展示细菌分类单元丰度的动态变化特征
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 65.73 MiB
最后更新 2025年12月9日
创建于 2025年12月9日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。