数据集概述
本数据集围绕TOMM方法展开，这是一种基于蛋白质编码基因进化距离的无监督系统发育组学分析新方法。通过直系同源检测和中位数氨基酸距离矩阵构建两个步骤，在动基体目原生动物、吸血双翅目媒介昆虫和灵长类三个生物类群中验证了方法的稳健性，为系统发育关系研究提供了替代分析工具。
文件详解
- 文件名称: Supplemental_Figures_S1_S2_S3_S4_S5_S6_S7.pdf，文件格式: PDF，内容: 包含支持TOMM方法验证的7张补充图表，可能涉及不同生物类群的系统发育树或距离矩阵可视化结果
- 文件名称: SupplementalTable_S1.xlsx，文件格式: XLSX，内容: 补充表格1，推测为TOMM方法分析中使用的基础数据或统计结果
- 文件名称: SupplementalTable_S2.xlsx，文件格式: XLSX，内容: 补充表格2，推测为不同生物类群的直系同源基因检测结果或距离矩阵数据
- 文件名称: SupplementalTable_S3.xlsx，文件格式: XLSX，内容: 补充表格3，推测为系统发育树构建的关键参数或验证指标数据
- 文件名称: SupplementalTable_S4.xlsx，文件格式: XLSX，内容: 补充表格4，推测为TOMM方法与传统方法的比较分析结果
- 文件名称: Supplemental_File2.tar.gz，文件格式: TAR.GZ，内容: 压缩归档文件，可能包含TOMM方法的源代码、原始数据或中间结果文件
- 文件名称: SupplementalFile1.txt，文件格式: TXT，内容: 文本文件，根据预览包含R语言代码片段，涉及pvclust、snow、ape等系统发育分析相关库的调用
适用场景
- 系统发育组学研究: 用于构建基于蛋白质编码基因进化距离的系统发育树
- 生物分类学分析: 验证不同生物类群（如原生动物、昆虫、灵长类）的分类关系
- 计算生物学方法开发: 作为对比数据集，评估新型系统发育分析算法的性能
- 进化生物学研究: 探究生物类群间的进化关系及分支拓扑结构的变异机制
