数据集概述
本数据集包含动物园非洲草原象粪便样本的宏基因组Kraken2分类报告,通过非侵入性粪便DNA采样结合基因组技术生成,涵盖宿主及微生物(植物、真菌、节肢动物、细菌等)分类信息,用于野生动物保护相关的基因组与宏基因组分析,共7个文件。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:说明数据集背景、文件结构,提及每个文件对应单头大象粪便样本的连续采样时间点数据,关联论文"Blending methods for non-invasive fecal DNA opens whole genome and metagenomic analyses in wildlife biology"。
- 宏基因组分类报告文件
- 文件名称:sheena_20220111.xlsx、thandi_20220111.xlsx、mlilo_20220111.xlsx、jenny_20220111.xlsx、Tendaji_20220111.xlsx、ali_20220111.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:每个文件对应一头大象的粪便样本,包含连续采样时间点的宏基因组分类数据,涵盖宿主(非洲草原象)及相关微生物的分类信息。
数据来源
论文"Blending methods for non-invasive fecal DNA opens whole genome and metagenomic analyses in wildlife biology"
适用场景
- 野生动物非侵入性基因组研究: 分析粪便样本中大象内源DNA比例及遗传变异,支持种群遗传结构研究。
- 宏基因组分类分析: 解析大象粪便样本中的宿主、植物、真菌、细菌等生物类群组成,研究宿主-微生物互作。
- 野生动物保护技术应用: 验证非侵入性粪便DNA采样结合基因组技术在濒危物种保护中的实用性。
- 病原体与寄生虫监测: 通过宏基因组数据识别大象相关的病原体和寄生虫,为健康管理提供依据。