数据集概述
本数据集围绕全球重要海草Zostera marina展开,聚焦其跨热梯度种群的系统地理分化与转录组热适应机制。通过空间代时间设计,在欧洲和北美沿岸南北种群的公共花园中模拟热浪,记录控制、热应激及恢复阶段的转录组响应,包含约1.3万个注释基因数据,可用于解析热适应的分子基础及系统地理分化对适应的影响。
文件详解
- 数据文件(.xlsx格式,共11个)
- 文件名称:stab1.xlsx、stab2.xlsx、TabS4.xlsx、TabS6.xlsx、TabS8.xlsx、TabS9.xlsx、TabS10.xlsx、TabS11.xlsx等
- 字段映射介绍:推测包含转录组差异表达基因统计、系统地理分化分析结果、热应激响应指标等结构化数据(具体字段需参考文件内容)
- 变异数据文件(.vcf格式,1个)
- 文件名称:DatasetS1.vcf
- 字段映射介绍:包含Zostera marina种群的基因变异信息,用于系统地理分化分析
数据来源
论文“Phylogeographic differentiation versus transcriptomic adaptation to warm temperatures in Zostera marina, a globally important seagrass”
适用场景
- 海洋植物热适应机制研究: 分析Zostera marina转录组对热应激的响应模式,解析热适应的分子通路
- 系统地理分化与适应性进化关联分析: 结合基因变异数据,探究系统地理分化对种群热适应能力的影响
- 海草抗逆性评估: 基于光合作用、病原体防御相关基因的表达变化,评估热胁迫对海草生理功能的影响
- 全球变暖生态响应预测: 利用空间代时间设计的结果,预测Zostera marina种群对未来气候变暖的适应潜力