数据集概述
该数据集围绕空间表观基因组学技术展开，记录了基于双条形码DNA阵列捕获未负载PA-Tn5转座酶的组织染色质状态图谱研究数据。包含小鼠脑、胚胎及爪组织的空间表观基因组矩阵、伪 bulk 富集文件、图像文件及处理说明，为研究组织染色质状态的空间分布及基因转录调控提供支持。
文件详解
该数据集由四个目录及相关文件组成，具体说明如下：
- Spatial_epigenomics_matrices/ 目录：
- 包含多个TSV格式矩阵文件，如 MouseBrain_H3K4me3_QNorm_SpatialEpigenomics_Matrix.tsv、mouse_paws_FFPE_H3K27Ac_QNorm_SpatialEpigenomics_Matrix.tsv 等，记录不同组织样本（小鼠脑、胚胎、爪）在特定组蛋白修饰下的空间表观基因组标准化数据。
- readme_SpatialOmics_processing.txt：TXT格式说明文件，可能包含空间组学数据处理流程的相关信息。
- pseudo-bulk_enrichment_files/ 目录：
- 包含多个BDG格式文件，如 CIA_FFPE_paws_Readcounts_Norm_H3K27ac_paws_Cl1_pseudoBulk.bdg、Mouse_Brain_H3K4me3_pseudoBulk.bdg 等，记录伪 bulk 富集的标准化读段计数数据。
- spatial_epigenomics_Images/ 目录：
- 包含多个PNG格式图像文件，如 MouseBrain_H3K4Me3_ImmunoLabel.png、mouseEmbryo(E11.5)_H3K27ac_wBorders_TRITC-6YvkbW.png 等，展示不同组织样本的免疫标记及染色质状态空间分布图像。
- 根目录说明文件：
- readme_SpatialOmics_processing.txt：可能为空间组学数据处理的说明文档。
适用场景
- 空间表观遗传学研究：分析不同组织中染色质状态的空间分布特征。
- 基因转录调控研究：探究组蛋白修饰与基因转录状态的关联。
- 组织发育研究：揭示小鼠胚胎发育过程中染色质状态的动态变化。
- 疾病机制研究：为理解疾病中组织染色质结构失调提供数据支持。
- 空间组学技术验证：验证双条形码DNA阵列捕获未负载PA-Tn5转座酶技术的有效性。
