数据集概述
本数据集包含基于Histo-μSim框架的离体小鼠组织扩散MRI与苏木精-伊红(HE)组织学数据,样本来自MMTV-PyMT转基因小鼠及叶酸诱导肾损伤模型,通过9.4T系统扫描,为MRI癌症表征研究提供微观结构模拟基础数据。
文件详解
- 说明性文件:
- sample_illustration.pdf、sample_illustration.pptx:样本示意图,展示实验样本的基本信息
- acquisition_information.txt:详细记录动物模型、MRI及组织学采集的技术参数与流程
- LICENSE.txt、README.txt、acknowledgements.txt:版权声明、数据集说明及致谢信息
- 核心数据文件:
- exvivo_mouse.zip:压缩包包含:
- 组织学数据(histology目录):HE染色图像(.ndpi格式)、手动细胞分割文件(SVG格式)
- 扩散MRI数据(scans目录):原始及预处理的dMRI扫描文件(.nii格式)、b值(.bval)、梯度方向(.bvec)等参数文件
- 分析结果文件:maps_analyticalmodel(双室分析模型参数图)、maps_HistouSim(Histo-μSim模型参数图)
数据来源
Vall d'Hebron Institute of Oncology (VHIO)
适用场景
- 医学影像研究:验证组织学引导的扩散MRI微观结构模拟在癌症表征中的应用效果
- 肿瘤学研究:分析小鼠乳腺癌、肾损伤模型中组织微观结构与MRI信号的关联
- 数据处理算法开发:用于扩散MRI预处理(去噪、去伪影)及参数拟合算法的测试与优化
- 跨模态数据融合研究:探索组织学图像与MRI数据的整合方法及生物标志物提取
- 医学物理学研究:评估高场强(9.4T)MRI系统在微观结构成像中的性能