找到30个数据集

分类: 公开数据 标签: 蛋白质序列

过滤结果

  • TotalProt蛋白酶选择工具补充信息数据集

    2025年12月19日 30 157 77

    数据集概述 本数据集为“TotalProt——一种利用质谱技术选择蛋白酶以实现蛋白质序列完全覆盖的工具”相关研究的补充信息。包含1个PDF格式的补充文档，主要用于提供研究的额外支撑材料，如相关图表等，为理解该工具的技术细节和应用场景提供辅助数据支持。 文件详解 文件名称: TotalProt Supplementary Figures1.2.pdf...
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  • 共受体BAK1的变构激活与免疫信号启动补充信息数据集

    2025年12月18日 30 73 53

    数据集概述 该数据集为研究论文《共受体BAK1的变构激活与免疫信号启动》的补充信息集合，包含质粒图谱、系统发育分析文件、复制信息、图像裁剪信息、基因ID及蛋白质序列等关键支撑材料，用于验证和补充论文核心研究内容。 文件详解 文档类文件： ReplicationInformation.pdf：PDF格式，提供实验复制相关的说明信息...
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  • AlphaFold2局限性克服的蛋白质序列深度突变扫描与稳定性选择数据集

    2025年12月18日 30 210 190

    数据集概述 本数据集围绕克服AlphaFold2对天然同源序列依赖的局限性展开，包含通过深度突变扫描和稳定性选择生成的人工同源蛋白质序列数据，用于提升稀疏序列家族蛋白质的结构预测准确性。 文件详解 该数据集包含5个压缩文件，具体说明如下： - Sibs-Seq.zip：ZIP格式压缩文件，内容未提供详细预览 -...
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  • 细菌UL23_01_03的DFAST分析数据集

    2025年12月18日 30 112 26

    数据集概述 本数据集为细菌UL23-01-03的DFAST分析结果，包含基因组序列、注释信息、质量检查报告及功能分析数据，覆盖RNA、蛋白质、基因特征等多维度生物学信息，为该细菌的分子生物学研究提供全面数据支持。 文件详解 序列与注释文件： rna.fna.txt：TXT格式，包含tRNA等RNA序列信息...
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  • pLMMoRF预测器脚本与人类蛋白质组MemMoRF预测数据集

    2025年12月17日 30 191 164

    数据集概述 本数据集包含pLMMoRF预测器脚本及人类蛋白质组的MemMoRF预测结果。核心内容围绕膜相互作用分子识别特征的预测数据展开，包含预测脚本、实验过滤数据及人类蛋白质组预测结果文件，为相关生物信息学研究提供支持。 文件详解 文件名称: README.md，文件格式: Markdown，内容: 数据集说明文档，包含项目链接及各文件内容介绍。...
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  • 长读长蛋白质基因组学增强蛋白质异构体表征测试数据集

    2025年12月15日 30 156 66

    数据集概述 该数据集为长读长蛋白质基因组学方法提供测试数据，该方法整合长读长RNA测序与质谱蛋白质组学数据以增强蛋白质异构体表征，包含转录本、肽段、基因注释等相关测试文件。 文件详解 该数据集包含122个文件，主要类型及示例如下： -...
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  • 天然通道视紫红质目录数据集

    2025年12月15日 30 197 13

    数据集概述 本数据集是天然通道视紫红质（ChRs）的目录资源，包含原始列表与更新列表两个核心Excel文件，以及AlphaFold3预测的结构压缩包。数据覆盖序列信息、分类归属、功能活性等维度，为通道视紫红质的研究提供系统性参考。 文件详解 该数据集包含3个核心文件，具体说明如下： - 原始列表文件: - 文件名称:...
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  • 酶编码基因功能注释深度学习研究补充数据集

    2025年12月15日 30 139 109

    数据集概述 本数据集是论文《Improved annotation of enzyme-encoding genes using deep learning with transformer layers》的补充数据，包含酶编码基因功能注释相关的预测结果、序列可视化及基序分析等7份数据文件，支持深度学习在酶基因注释领域的研究验证。 文件详解...
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  • 日本温带地区珊瑚分离的涡鞭毛虫Effrenium_voratum菌株首次基因组序列补充材料

    2025年12月15日 30 128 55

    数据集概述 本数据集为日本温带五岛列岛海域珊瑚分离的涡鞭毛虫Effrenium voratum菌株（NIES-2908）的首次基因组序列研究补充材料，包含基因组组装、基因注释文件及研究相关图表和表格，为共生生物分子生物学及比较基因组学研究提供资源。 文件详解 该数据集包含以下文件，具体说明如下： - 基因组序列与注释文件（压缩格式.gz）： -...
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  • 基于图的蛋白质序列短串联重复聚类方法数据集与代码

    2025年12月14日 30 202 155

    数据集概述 本数据集包含复现"基于图的序列聚类（GBSC）方法"分析所需的全部数据与代码，该方法用于识别蛋白质序列中的相似短串联重复序列。 文件详解 文件名称：gbsc-analysis-release.zip 文件格式：ZIP压缩包（.zip） 文件内容：包含复现GBSC方法分析所需的所有数据与代码文件，具体内部结构需解压后查看 适用场景...
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  • 结构感知后翻译修饰预测数据集_SAPP

    2025年12月13日 30 37 1

    数据集概述 该数据集为结构感知后翻译修饰（PTM）预测（SAPP）相关研究的训练、测试数据及结果文件集合，涵盖磷酸化、乙酰化等多种PTM类型数据及相对溶剂可及性（RSA）特征文件，支持PTM预测模型开发与评估。 文件详解 该数据集包含两个核心目录，具体说明如下： - Datasets/ 目录： - SAPPphos:...
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  • AlphaFold2蛋白质序列比对改进研究数据集

    2025年12月10日 30 137 37

    数据集概述 本数据集包含论文《Highly significant improvement of protein sequence alignments with AlphaFold2》的补充表格、图表及数据集压缩包，核心内容围绕AlphaFold2对蛋白质序列比对性能的提升展开，为生物信息学领域相关研究提供数据支持。 文件详解...
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  • 玉米叶片发育连续阶段蛋白质组与磷酸化蛋白质组平行分析数据集

    2025年12月10日 30 166 138

    数据集概述 本数据集包含玉米叶片四个发育阶段的蛋白质组与磷酸化蛋白质组定量分析数据，涵盖细胞分裂、分化、扩张至成熟叶片的过渡过程，揭示翻译后调控在发育转换中的作用，为玉米叶片发育机制研究提供资源。 文件详解 该数据集包含八个文件，具体说明如下： - 文档文件： -...
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  • 细菌与古菌功能系统预测的时空基因组分析数据集

    2025年12月10日 30 166 111

    数据集概述 本数据集为"细菌与古菌功能系统预测的时空基因组分析"研究的补充数据，包含多种格式的文件，涵盖基因组数据压缩包、实验数据表、研究图表、序列文件及系统发育树等，为相关基因组分析提供支持。 文件详解 该数据集包含33个文件，具体说明如下： - 压缩包文件（.tgz格式，共17个）： -...
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  • 嗜冷菌蛋白质组稳定性与生存能力关联数据集

    2025年12月9日 30 117 74

    数据集概述 该数据集为论文《Cytoplasmic Fluidity and the Cold Life: Proteome Stability is Decoupled from Viability in Psychrophiles》的配套数据，包含嗜冷菌（如北极嗜冷杆菌）与大肠杆菌蛋白质的DeepSTABp熔点预测数据及相关蛋白质序列信息。...
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  • 进化参数推断的模糊编码方法研究数据集

    2025年12月9日 30 155 140

    数据集概述 本数据集聚焦于蛋白质进化历史的研究，探讨如何通过模糊编码处理缺失数据，从低分辨率序列（如氨基酸序列）中准确推断进化参数（如选择强度ω、祖先侧链构型），并验证该方法在模拟与实证数据中的有效性。 文件详解 文件名称：Ambiguity_SYSBIO_suppmat.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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  • PPM1H磷酸酶对Rab_GTPases特异性的结构基础数据集

    2025年12月8日 30 175 15

    数据集概述 本数据集围绕PPM1H磷酸酶对Rab GTPases的特异性结构基础展开，包含相关实验的凝胶图像、数值数据、蛋白质序列及结构分析文件，为研究PPM1H通过 flap 结构域识别磷酸化Rab的机制提供实验数据支持。 文件详解 凝胶图像文件（.tif/.png格式）： 示例：Figure 1D Rab8A.tif、Figure 2A...
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  • 温带适应冰鱼基因组学补充数据集

    2025年12月7日 30 22 1

    数据集概述 本数据集为温带适应冰鱼基因组学研究的补充数据，包含温带梭冰鱼（Champsocephalus esox）、南极姐妹种贡氏冰鱼（Champsocephalus gunnari）及外类群巴塔哥尼亚鳚鱼的基因组组装与注释文件，用于分析温带适应的遗传机制，涉及染色体结构、选择通路及抗冻基因演化等内容。 文件详解 说明文档：...
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  • TernaryDB三元复合物数据集

    2025年12月7日 30 135 124

    数据集概述 该数据集是从蛋白质数据银行（PDB）中筛选出的22,303个三元复合物综合数据集，用于支持基于深度学习的靶向蛋白降解（TPD）复合物结构预测研究。 文件详解 文件名称: TernaryDB.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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  • 霞多丽基因组组装与注释数据集

    2025年12月7日 30 185 131

    数据集概述 本数据集包含霞多丽（Chardonnay）葡萄的基因组组装数据及相关注释信息，涵盖组装序列、基因预测、功能注释、重复序列、染色体定位、亲本溯源等多维度内容，为葡萄基因组学研究提供全面的数据支持。 文件详解 基因组组装文件： chardonnay_p-ctg.fasta.gz：FASTA格式，单倍体主组装序列（primary contigs）...
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