数据集概述
本数据集为日本温带五岛列岛海域珊瑚分离的涡鞭毛虫Effrenium voratum菌株（NIES-2908）的首次基因组序列研究补充材料，包含基因组组装、基因注释文件及研究相关图表和表格，为共生生物分子生物学及比较基因组学研究提供资源。
文件详解
该数据集包含以下文件，具体说明如下：
- 基因组序列与注释文件（压缩格式.gz）：
- NIES2908.cds.fa.gz：编码序列文件
- NIES2908.cds.longest.fa.gz：每个基因最长编码序列文件
- NIES2908.protein.fa.gz：蛋白质序列文件
- NIES2908.protein.longest.fa.gz：每个基因最长蛋白质序列文件
- NIES2908.gtf.gz：GTF格式的基因注释文件
- 图表文件（PDF格式）：
- FigS1.pdf：基因组组装和基因注释工作流程示意图
- FigS2.pdf：基因组大小估计图表
- FigS3.pdf：基于18S rRNA的分子系统发育树
- 数据表格文件（XLSX格式）：
- Tables.xlsx：原始数据、基因注释用蛋白质组及基因组/基因模型统计信息表格
- 对应表文件（TXT格式）：
- Contig.acclist.txt：Contig编号与GenBank登录号的对应表
适用场景
- 分子生物学研究：分析Effrenium voratum菌株的基因结构与功能
- 比较基因组学研究：探究温带地区涡鞭毛虫的局部适应性机制
- 共生生物学研究：作为非共生涡鞭毛虫对照，研究共生关系分子基础
- 进化生物学研究：通过18S rRNA系统发育树分析物种进化关系
- 基因组学方法学研究：参考基因组组装与注释的工作流程设计
