找到25个数据集

分类: 公开数据 标签: 454测序

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  • 欧洲狍免疫遗传多样性研究数据

    2026年2月12日 30 194 158

    数据集概述 本数据集聚焦欧洲狍免疫遗传异质性研究,包含MHC-DRB基因原始数据、基因型数据、微卫星基因型数据、单倍型序列比对等文件,涉及先天与获得性免疫相关基因(如TLRs、细胞因子编码基因)的遗传变异分析,为研究野生动物免疫基因进化及病原体响应机制提供数据支持。 文件详解 原始数据文件 文件名称:MHC-...
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  • 北美陆龟鼻部微生物群落与病原体研究数据

    2026年2月10日 30 28 25

    数据集概述 本数据集包含四种北美陆龟的鼻微生物群落测序数据,记录了不同陆龟物种及采样点的群落组成差异,分析了潜在病原体Pasteurella testudinis的流行度与多样性,以及鼻分泌物对微生物组的影响。数据集含3个文件,用于支持爬行动物微生物组与宿主健康关系的研究。 文件详解 文件名称:otu_bacteriaonly.biom...
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  • 南极毛皮海狮皮肤转录组基因发现与标记数据

    2026年2月9日 30 61 60

    数据集概述 本数据集基于12只南极毛皮海狮皮肤活检样本的标准化cDNA文库,通过454测序生成超412Mb序列数据,包含156个contigs、22869个isotigs及18576个isogroups。数据覆盖多种功能基因,多数可映射至犬类基因组,支持海洋哺乳动物基因组资源开发,用于解决鳍足类生态与进化问题。 文件详解 Sequence...
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  • Scabiosa_columbaria_转录组测序与基因组工具开发数据

    2026年2月6日 30 85 82

    数据集概述 本数据集为非模式植物Scabiosa columbaria...
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  • Hiiesalu_etal_植物地下物种丰富度研究数据

    2026年1月31日 30 164 39

    数据集概述 本数据集通过传统物种鉴定与454测序技术,对比草地生态系统中相同体积(0.1×0.1×0.1m)土壤表层上下的植物物种丰富度,分析多空间尺度下地上地下丰富度差异及与土壤肥力的关系,揭示地下物种丰富度更高的新规律。数据集包含2个文件,无目录结构。 文件详解...
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  • SNP_Based_淡水黄貂鱼杂交与种群结构检测标记数据

    2026年1月30日 30 77 9

    数据集概述 本数据集包含对淡水黄貂鱼Potamotrygon motoro和Potamotrygon falkneri两种物种的单核苷酸多态性(SNP)标记识别与验证数据。通过ddRAD技术获取454测序数据,筛选出143个候选SNP,其中82个成功验证,61个具有多态性,可用于种群分析和杂交检测。数据集共包含4个文件。 文件详解...
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  • Megabunus_Source_盲蛛SNP发现测序数据集

    2026年1月29日 30 138 7

    数据集概述 本数据集为Megabunus属盲蛛(Opiliones目)的简化基因组测序数据,通过下一代测序技术开发单核苷酸多态性(SNP)标记,是目前该属盲蛛可用的最大基因组资源,支持盲蛛遗传多样性与系统发育研究。 文件详解 文件名称:FASTA and ALN files...
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  • Symphonia_Based热带树种基因组工具开发及遗传标记数据

    2026年1月27日 30 85 46

    数据集概述 本数据集包含热带树种Symphonia globulifera的基因组工具开发成果,包括首个低覆盖度(11X)基因组草图、单核苷酸多态性(SNP)及简单序列重复(SSR)标记数据。数据覆盖该树种67.5%的预估基因组大小,含基因注释、SSR标记及跨地理种群的遗传多态性信息,可支持种群遗传学及比较基因组学研究。 文件详解...
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  • Tetramorium_454_Based核标记开发与引物设计数据2015

    2026年1月21日 30 169 82

    数据集概述 本数据集为Tetramorium(膜翅目:蚁科)物种复合体的核DNA标记开发研究成果,基于简化代表性文库(RRL)和454测序技术,包含测序原始数据、序列比对结果、分析脚本及引物设计相关文件,可用于昆虫物种界定与分子标记开发研究。 文件详解 序列比对文件 文件名称:alignments.zip 文件格式:ZIP...
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  • Dryad_Source_Attwater草原鸡免疫基因与生存相关性研究数据集

    2026年1月19日 30 11 0

    数据集概述 本数据集来自对极度濒危的Attwater草原鸡的研究,探讨免疫基因特定等位基因而非全基因组杂合性与免疫反应及生存的关系。包含9个文件,涵盖免疫基因分析数据、生存分析输入数据、基因序列文件及分析说明文档,支持对濒危物种免疫适应性和生存机制的研究。 文件详解 数据文件(.xlsx/.csv/.fna)...
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  • Malausa_et_al_MER_Dryad_高通量微卫星分离454测序数据

    2026年1月19日 30 86 60

    数据集概述 本数据集包含基于454 GS-FLX...
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  • MHC_Based_主要组织相容性复合体基因_先天性与适应性免疫系统相互作用研究数据

    2026年1月18日 30 97 96

    数据集概述 本数据集为“主要组织相容性复合体(MHC)基因突出先天性与适应性免疫系统相互作用”研究的关联数据,包含家麻雀MHC基因多样性及免疫功能相关的实验数据与分析结果。通过平行扩增子测序识别MHC...
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  • Temperature_Based_豆科植物_植食螨_捕食螨三营养级温度依赖互作数据

    2026年1月18日 30 73 11

    数据集概述 本数据集记录了温度对菜豆、二斑叶螨(Tetranychus urticae)和智利小植绥螨(Phytoseiulus persimilis)三营养级互作的影响,涵盖植物挥发物释放、螨类繁殖与捕食行为、转录组表达等多维度数据,揭示不同温度下三者的生理行为响应差异,共包含8个文件。 文件详解 捕食测定数据(predation...
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  • Artibeus_lituratus_Based_微卫星位点开发与筛选及跨物种适用性数据

    2026年1月13日 30 156 36

    数据集概述 本数据集记录了通过高通量测序技术为叶口蝠科的广泛分布物种Artibeus lituratus开发微卫星位点的过程,包含发现的微卫星位点、设计的引物及跨物种扩增测试结果,为该物种及6种近缘叶口蝠科物种的种群遗传学研究提供标记资源。 文件详解 README文件(共3个)...
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  • MHC_Salvelinus_fontinalis_养殖溪红点鲑种群基因多样性与免疫表达研究数据

    2026年1月11日 30 202 66

    数据集概述 本数据集围绕养殖溪红点鲑(Salvelinus fontinalis)种群的MHC基因多样性与表达展开,研究中性与选择过程对其的影响,以及人工养殖个体补充对宿主-寄生虫互作动态的干扰。包含基因序列、寄生虫感染数据、基因型数据及实验室实验数据,共6个文件,覆盖2008至2012年研究周期。 文件详解 MHC基因序列文件...
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  • Metagenetic_Based深海浅海沉积物微生物真核生物社区生物地理模式数据

    2026年1月15日 30 25 24

    数据集概述 本数据集通过宏遗传方法分析深海与浅海沉积物中的微生物真核生物(线虫、原生生物、真菌等)群落。涵盖太平洋、大西洋等海域的深度梯度样本,探究其生物地理分布模式、物种遗传结构及分类学特征,为理解海洋生态系统功能及环境变化影响提供数据支持。 文件详解 聚类OTU数据压缩包 文件名称:Clustered_OTUdata.zip 文件格式:ZIP...
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  • Megalomyrmex_Based_社会寄生虫与真菌种植蚁宿主细菌共生体共享研究数据

    2026年1月14日 30 199 40

    数据集概述 本数据集围绕Megalomyrmex社会寄生虫与其真菌种植蚁宿主的细菌共生体共享展开,通过测序和实验分析,探究不同程度巢共享下两者的微生物群落相似性、感染动态及传播模式,涉及共生体多样性、基因型一致性及饮食操纵实验等内容,包含8个相关文件。 文件详解 Sericomyrmex_COI_alignment_and_tree.zip...
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  • Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据

    2026年1月13日 30 134 111

    数据集概述 本数据集为白足鼠(Peromyscus leucopus)的转录组资源,包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果,用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应,共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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  • Plant_Insect_Diversity_Based热带景观植物昆虫多样性关联研究数据

    2026年1月12日 30 140 80

    数据集概述 本数据集围绕热带景观中植物多样性与昆虫多样性的关联展开,通过 metabarcoding 技术分析两处热带景观的 Malaise 诱捕样本,验证植物物种丰富度对昆虫物种丰富度的预测能力及群落组成相关性。包含测序数据、环境参数、生物信息学脚本等16个文件,支持生物多样性机制研究与保护应用。 文件详解 环境参数文件...
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  • Ambystoma_tigrinum_Based_北美虎纹钝口螈物种复合体种群遗传与系统发育分析数据

    2026年1月4日 30 95 63

    数据集概述 本数据集为北美虎纹钝口螈物种复合体的种群遗传与系统发育研究数据,通过平行标记扩增子测序技术对95个核基因座、93个个体的样本进行分析,包含生物信息学处理后的基因型、单倍型序列等结果,可用于遗传聚类、物种树构建等研究,共含5个文件。 文件详解 Structure Files.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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