数据集概述
本数据集围绕热带景观中植物多样性与昆虫多样性的关联展开，通过 metabarcoding 技术分析两处热带景观的 Malaise 诱捕样本，验证植物物种丰富度对昆虫物种丰富度的预测能力及群落组成相关性。包含测序数据、环境参数、生物信息学脚本等16个文件，支持生物多样性机制研究与保护应用。
文件详解
- 环境参数文件
- 文件名称：YGLenv.csv、MSenv.csv、YGL_treedensity.csv、MS_Tree_output_5cm.csv、MS_Plant_output.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含海拔（Elevation）、UTM坐标（UTM_E、UTM_N）、采样时间（Time）、树木密度、植物物种输出等景观环境与植物特征参数
- 群落数据文件
- 文件名称：MBCar_YGL.csv、MBCar_MS.rar
- 文件格式：CSV、RAR
- 字段映射介绍：记录不同采样点（如Y7、Y9等）的物种（域、门、纲、目、科、属、种）丰度数据
- 测序数据文件
- 文件名称：454sequencer_dataset_YGL.tar.gz、454sequencer_dataset_MS.tar.gz、submission_fastq_MS.tar.gz、submission_fastq_YGL.tar.gz
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：包含454测序平台与提交的fastq格式原始测序数据
- 生物信息学脚本与结果文件
- 文件名称：bioinformatic_script_MS.zip、bioinformatic_script_YGL.zip、MSall_CROP97_DNACLUST_otus_r0.cluster.fasta、YGL_CROP97_otus_z5k.cluster.fasta、Plants_accurately_predict_insects.Rmd
- 文件格式：ZIP、FASTA、Rmd
- 字段映射介绍：生物信息学分析脚本、OTU聚类结果（fasta格式）及R markdown分析文档
适用场景
- 生物多样性机制研究: 验证植物多样性对昆虫多样性的预测能力，分析热带生态系统中物种间的关联机制
- 生态保护规划: 利用植物-昆虫群落相关性，优化生物多样性监测与保护策略的效率
- 环境监测应用: 通过植物群落 proxy 评估森林退化与恢复过程中的昆虫多样性变化
- 宏条形码技术应用: 探索 metabarcoding 技术在大规模、异质性景观生物多样性研究中的可行性与标准化流程
