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标签: OTU聚类

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  • 驾驶员对南海细菌群落多样性与生物地理学研究数据的影响

    2026年1月31日 30 17 15

    数据集概述 本数据集围绕南海总细菌与活性细菌群落的多样性及生物地理学驱动因素展开,通过454焦磷酸测序技术分析16S rRNA(活性群落)和16S rRNA基因(总群落)的V1-3区域,探究环境因素与地理距离对两类群落的影响差异,包含8个相关分析文件。 文件详解 CANOCO输入文件(CANOCO input files.rar) 文件格式:RAR...
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  • DRYAD_Satleretal_瓶子草共生真核生物共多样化研究数据

    2026年1月26日 30 150 104

    数据集概述 本数据集包含瓶子草(Sarracenia alata)共生真核生物的基因序列数据,用于研究生态群落成员的共多样化模式。通过454扩增子宏基因组学技术,分析宿主植物对共生生物遗传结构的影响,验证共生真核生物与宿主是否具有相似进化历史。数据集含2个文件,支持进化生物学中关于共进化及群落结构形成机制的研究。 文件详解...
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  • Pyrenean_desman_Based_濒危食虫动物粪便饮食宏条形码引物选择数据

    2026年1月18日 30 187 81

    数据集概述 本数据集来自比利牛斯鼬鼹粪便饮食分析的引物筛选研究,针对该濒危食虫动物的粪便样本,测试五种宏条形码引物(Brandon-Mong、Gillet、Leray、Meusnier、Zeale)的PCR扩增及测序效果,通过OTU聚类与数据库比对分析引物性能,为优化该物种食性研究方法提供数据支持。 文件详解...
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  • MEGAFAUNA_Pole2Pole_Based_全球海洋鱼类eDNA序列数据集

    2026年1月15日 30 128 48

    数据集概述 本数据集包含2017-2020年在全球11个海洋区域、68个地点、263个站位采集的鱼类环境DNA(eDNA)序列,基于12S线粒体基因。序列经生物信息学流程处理,包含OTU聚类及分类学注释,可用于研究大空间尺度下鱼类eDNA分布及环境、社会经济和地理因素对其多样性的影响。 文件详解...
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  • Megalomyrmex_Based_社会寄生虫与真菌种植蚁宿主细菌共生体共享研究数据

    2026年1月14日 30 60 44

    数据集概述 本数据集围绕Megalomyrmex社会寄生虫与其真菌种植蚁宿主的细菌共生体共享展开,通过测序和实验分析,探究不同程度巢共享下两者的微生物群落相似性、感染动态及传播模式,涉及共生体多样性、基因型一致性及饮食操纵实验等内容,包含8个相关文件。 文件详解 Sericomyrmex_COI_alignment_and_tree.zip...
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  • Plant_Insect_Diversity_Based热带景观植物昆虫多样性关联研究数据

    2026年1月12日 30 13 10

    数据集概述 本数据集围绕热带景观中植物多样性与昆虫多样性的关联展开,通过 metabarcoding 技术分析两处热带景观的 Malaise 诱捕样本,验证植物物种丰富度对昆虫物种丰富度的预测能力及群落组成相关性。包含测序数据、环境参数、生物信息学脚本等16个文件,支持生物多样性机制研究与保护应用。 文件详解 环境参数文件...
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  • EAW_16S_rRNA基因生物信息学课程FASTQ文件2018

    2025年12月6日 30 55 46

    数据集概述 本数据集包含二零一八年九月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的六个样本的十六S核糖体RNA基因测序数据,采用Illumina MiSeq技术生成,含正向(R1)和反向(R2)测序文件及相关描述文档,适用于生物信息学课程教学与实践。 文件详解 该数据集包含十四份文件,具体说明如下: - 描述文档: -...
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