数据集概述
本数据集包含2017-2020年在全球11个海洋区域、68个地点、263个站位采集的鱼类环境DNA(eDNA)序列,基于12S线粒体基因。序列经生物信息学流程处理,包含OTU聚类及分类学注释,可用于研究大空间尺度下鱼类eDNA分布及环境、社会经济和地理因素对其多样性的影响。
文件详解
- Metadata_eDNA_Pole2Pole_v4.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含code_spygen(样本编码)、code_explo(考察编码)、rep(重复编号)、date(采集日期)、station(站位)、site_name(地点名称)、province(省份)、country(国家)、project(项目)、sample_type(样本类型)、sample_method(采样方法)、time_start(开始时间)、time_end(结束时间)、duration_min(时长)、volume(体积)、depth_sampling(采样深度)、depth_seafloor(海底深度)、temperature(温度)、turbidity(浊度)、habitat(栖息地)等元数据字段
- README.md
- 文件格式:MD
- 内容说明:记录数据处理说明、作者信息(Laetitia Mathon等)及数据背景
- Data.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包,推测包含经处理的鱼类eDNA序列核心数据
适用场景
- 全球海洋鱼类生物多样性监测: 分析大空间尺度下鱼类eDNA分布特征及多样性格局
- 环境因子对鱼类分布影响研究: 探究温度、浊度、栖息地等环境因素与鱼类eDNA多样性的关联
- 海洋分子生态学研究: 基于12S线粒体基因序列开展鱼类分类学及系统发育分析
- 生物信息学方法验证: 利用提供的分析代码(GitHub仓库)复现或优化eDNA数据处理流程
- 海洋保护政策制定: 为全球海洋区域的鱼类资源保护及栖息地管理提供数据支持