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Abedinium_Source_单细胞转录组与进化分析补充数据
数据集概述 本数据集包含甲藻Abedinium的单细胞转录组学研究相关补充文件，涵盖两个物种（A. dasypus和新种A. folium）的转录组序列、系统发育分析比对文件、补充视频及电子表格，用于支撑其作为新早期分支甲藻谱系的研究结论，涉及转录组特征、质体功能及线粒体基因组等分析内容。 文件详解 转录组序列文件...
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Symphonia_Based热带树种基因组工具开发及遗传标记数据
数据集概述 本数据集包含热带树种Symphonia globulifera的基因组工具开发成果，包括首个低覆盖度（11X）基因组草图、单核苷酸多态性（SNP）及简单序列重复（SSR）标记数据。数据覆盖该树种67.5%的预估基因组大小，含基因注释、SSR标记及跨地理种群的遗传多态性信息，可支持种群遗传学及比较基因组学研究。 文件详解...
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MicroRNAs_Based_小鼠肝脏昼夜节律转录组调控研究数据
数据集概述 本数据集围绕小鼠肝脏中microRNAs（miRNAs）对昼夜节律基因表达的调控作用展开，包含基因注释、测序计数表及补充文件等6个文件。核心内容为肝脏miRNA生物发生失活后的转录组测序结果，揭示miRNAs对核心时钟及输出基因表达的影响，涉及约30%节律转录组的相位和振幅调控，为研究组织特异性时钟驱动基因表达机制提供数据支持。 文件详解...
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Chlamydomonas_衣藻突变体库基因插入位点与功能分析数据
数据集概述 本数据集为莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii）的突变体库数据，包含1,935个已定位突变体，涉及1,562个基因的功能分析。通过高通量方法构建并验证了突变体插入位点，可用于研究光合真核生物的生物学过程，如脂质代谢等。数据集共11个文件，涵盖突变体信息、基因功能及实验验证数据。 文件详解...
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Drosophila_Sdic_Based基因家族早期进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕黑腹果蝇特有串联重复基因家族Sdic展开，包含其在20个地理种群中的结构与功能进化研究数据。通过基因组组装、读深分析及qPCR等方法，探究该基因家族的拷贝数变异、转座元件插入、基因转换及选择压力等特征，为理解串联重复基因家族的早期进化路径提供支持。 文件详解 文件名称：Dataset_1.xlsx 文件格式：XLSX...
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OGRDB_Based_小鼠CBA_J品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠CBA/J品系的免疫球蛋白κ轻链可变区（IGKV）基因胚系参考序列集，发布于开放胚系受体数据库（OGRDB）。包含基因序列文件、元数据文件及许可文件，可用于免疫遗传学领域的基因结构与功能研究，共4个文件。 文件详解 数据文件 文件名称：J IGKV_rev_1_ungapped.fasta 文件格式：FASTA...
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Genomes_and_models_居民群落与病原体基因组模型数据
数据集概述 本数据集包含居民群落与病原体的基因组序列及模型文件，共12个文件，涵盖.fna和.xml两种格式，各占50%。文件以QL编号命名，包含基因组序列数据和对应的元数据信息，为生物信息学研究提供基础数据支持。 文件详解 .fna格式文件（共6个） 文件名称示例：QL-117.fna、QL-A3.fna、QL-Rs1115.fna...
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Penstemon_MAKER2_Based基因预测注释与标记开发数据
数据集概述 本数据集是针对北美特有植物Penstemon属的基因预测与注释结果，通过MAKER2注释流程从6个极低覆盖度（约0.005×−0.007×）基因组中识别基因区域，支持系统发育标记开发。包含基因注释文件、序列文件等5个文件，可用于下游引物设计及序列分化分析。 文件详解 文件名称：Penstemon-MAKER-FuncAnnots.xlsx...
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OGRDB_Based_小鼠NZB_BlNJ品系IGLV种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠NZB/BlNJ品系IGLV种系参考集，包含种系序列文件、许可文件及元数据文件，共4个文件，覆盖FASTA、TXT、JSON三种格式，为免疫受体研究提供标准化的种系序列资源。 文件详解 种系序列文件 文件名称：BlNJ...
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OGRDB_Source_小鼠SJL_J品系IGLV受体胚系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠SJL/J品系IGLV受体胚系参考集，包含胚系基因序列及相关元数据，支持生物医学领域对免疫受体基因的研究，共包含四个文件。 文件详解 许可证文件 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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OGRDB_Source_小鼠NOR_LtJ品系IGKV受体胚系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠NOR/LtJ品系的免疫球蛋白κ轻链可变区（IGKV）受体胚系参考集，发布于开放胚系受体数据库（OGRDB）。包含胚系基因序列、注释等相关文件，支持免疫遗传学领域对小鼠IG受体胚系基因的研究与分析，共含4个文件。 文件详解 数据文件 文件名称：LtJ IGKV_rev_1_gapped.fasta 文件格式：FASTA...
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硕士论文补充材料_温度对甲壳类动物_如螃蟹_分子响应的影响_章节数据
数据集概述 本数据集为硕士论文《温度对贝类分子响应的影响》中蟹类章节（第2章）的补充材料，包含7个文件，涉及蟹类转录组数据、差异表达基因注释、功能富集分析结果等分子生物学相关内容，支持论文中温度对蟹类分子响应影响的研究验证与补充说明。 文件详解 contrast_temp-DAVID.txt 文件格式：TXT...
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OGRDB_Mouse_MSM_MsJ品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠MSM/MsJ品系IGKV基因胚系参考集，包含带间隙、无间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可说明文件，共4个文件，覆盖免疫遗传学研究所需的基因序列与元数据。 文件详解 基因序列文件（FASTA格式） 文件名称：MsJ...
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ProbioSML_Based_机器学习支撑益生菌基因序列数据库数据
数据集概述 本数据集是基于机器学习构建的益生菌序列数据库ProbioSML，包含1071个与已证实具有益生菌特性的微生物属相关的基因。数据集共4个文件，覆盖基因序列、预测结果及注释信息，为益生菌基因研究提供结构化资源。 文件详解 基因序列文件 文件名称：ProbioDB_1.0.faa、ProbioDB_1.0.ffn 文件格式：faa、ffn...
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奥弗里奥西斯_Ophryocystis_基因组组装序列及基因注释数据
数据集概述 本数据集包含两种Ophryocystis谱系的基因组组装、注释及基因序列数据，源自对君主蝴蝶寄生原虫Ophryocystis elektroscirrha的研究。数据涵盖直接测序的O. elektroscirrha谱系及从宿主基因组中生物信息学提取的类似谱系，后者完整性置信度较低且未在其他平台存档。 文件详解...
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OGRDB_Based_小鼠DBA_1J品系IGKV基因种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠DBA/1J品系IGKV基因种系参考集，包含基因序列文件、元数据文件及许可文件，共4个文件，为免疫基因组学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称：1J IGKV_rev_1_ungapped.fasta 文件格式：FASTA...
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GSE113293_Based_小鼠睾丸单细胞RNA测序基因调控分析数据
数据集概述 本数据集为小鼠睾丸单细胞RNA测序的处理数据，来自研究5种小鼠品系睾丸基因调控与病理学的统一单细胞分析。包含细胞元数据、标准化表达矩阵、基因注释、基因本体富集等关键分析结果，以及质控、基因调控概率矩阵等辅助数据，支持对睾丸细胞类型、基因表达模式及调控机制的研究。 文件详解 核心分析对象压缩包： 文件名称：SDA_objects.zip...
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Dexamethasone_Based_地塞米松多组织基因表达谱研究数据
数据集概述 本数据集通过全基因组微阵列技术，研究糖皮质激素受体激动剂地塞米松对成年雄性C57BL/6小鼠9种组织（肾上腺皮质、性腺周围脂肪组织、下丘脑、肝脏、肾脏、大腿前肌、垂体、脾脏和肺）基因表达的影响，结合染色质免疫沉淀测序等多源注释，揭示糖皮质激素系统性及组织特异性作用机制。 文件详解...
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NGS_Based_舞毒蛾与僧尼蛾表达序列标签数据集_2013_2014
数据集概述 本数据集基于NGS技术生成，包含舞毒蛾（Lymantria dispar）和僧尼蛾（Lymantria monacha）两种近缘鳞翅目林业害虫的表达序列标签数据，两种害虫对寄生蜂Glyptapanteles liparidis的寄生响应存在差异。数据集共6个文件，涵盖注释、比对、BLAST结果、实验方案及脚本、表格和重叠群等内容。 文件详解...
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Phrynosoma_Based_角蜥属系统基因组学靶向序列捕获研究数据
数据集概述 本数据集为角蜥属（Phrynosoma）系统基因组学研究的靶向序列捕获数据，包含540个超保守元件和44个蛋白编码基因的序列信息，用于解析17种角蜥的系统发育关系，解决此前分子系统发育分析中的冲突，支持四大亚群的分类框架，为比较分析提供基础。 文件详解 文件名称：Loci.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
