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Molluscan_Consensus_软体动物门系统发育评估数据
数据集概述 本数据集聚焦软体动物门的系统发育研究，整合42篇已发表的系统发育树数据，对比形态学与分子生物学推断的类群关系差异。通过分析类群间的节点距离模式，评估现有系统发育假说的一致性，为软体动物门高阶分类关系的后续研究提供参考依据。 文件详解 补充图表文件（EPS格式） 文件名称：suppl-...
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Tiger_shark_Based_虎鲨骨骼样本DNA提取实验数据
数据集概述 本数据集为虎鲨（Galeocerdo cuvier）骨骼样本DNA提取实验相关数据，包含实验中的qPCR原始数据、比率及引物探针信息，用于评估不同提取方法对DNA产量和质量的影响，支持回顾性遗传基因组分析研究。 文件详解 文件名称：Tiger QPCR raw data and ratios.xlsx 文件格式：XLSX...
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Genomes_and_models_居民群落与病原体基因组模型数据
数据集概述 本数据集包含居民群落与病原体的基因组序列及模型文件，共12个文件，涵盖.fna和.xml两种格式，各占50%。文件以QL编号命名，包含基因组序列数据和对应的元数据信息，为生物信息学研究提供基础数据支持。 文件详解 .fna格式文件（共6个） 文件名称示例：QL-117.fna、QL-A3.fna、QL-Rs1115.fna...
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Phyllospora_基于基因组学的水下森林恢复优化评估数据2020
数据集概述 本数据集为澳大利亚悉尼近海灭绝的Phyllospora comosa水下森林恢复项目的基因组学评估数据，包含供体种群遗传多样性分析、移植体存活与状态监测、恢复位点 recruits 遗传特征等核心内容，共6个文件，用于验证基因组学指导的海洋生态修复效果。 文件详解...
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USDA_NIFA_Based葡萄与病原菌基因组学抗病研究补充表格数据
数据集概述 本数据集是专家观点论文《Advances in grape and pathogen genomics toward durable grapevine disease resistance》的补充表格仓库，包含2个核心表格：葡萄抗病基因座列表和葡萄病原菌基因组组装信息，旨在为葡萄持久抗病性的基因组学研究提供结构化参考数据，总计1个文件。...
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Zymoseptoria_Based_植物病原体属基因组组装与注释数据
数据集概述 本数据集包含论文“Genome compartmentalization predates species divergence in the plant pathogen genus...
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BondetalData_Based_蜘蛛系统发育基因组学研究数据集
数据集概述 本数据集包含蜘蛛系统发育基因组学研究的关键数据，涉及所有主要蜘蛛类群的系统发育分析。研究基于基因组数据构建稳健的系统发育假说，挑战了传统圆网蜘蛛单系群的范式，对理解蜘蛛演化、生物材料及蜘蛛网表型具有重要意义。数据集含2个文件，支持深入分析蜘蛛类群关系及圆网演化机制。 文件详解 文件名称：README_for_BondetalData.txt...
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Pinus_cembra_Based_瑞士石松局部适应基因组研究数据
数据集概述 本数据集基于瑞士石松（Pinus cembra）转录组测序与外显子捕获技术，针对其大基因组（29.3 Gbp）开展局部适应研究。包含7个文件，涵盖群体信息、探针序列、等位基因频率、转录组组装与注释等核心内容，支持针叶树大基因组选择扫描与适应性遗传变异分析。 文件详解 群体信息文件...
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Dry_Forest_Birds_Genome_SNP分化基因流数据
数据集概述 本数据集记录南美干旱林鸟类种群分化与基因流研究的相关文件，涉及6个共分布类群对的基因组SNP数据及分析结果，核心研究干旱林鸟类群落因地理隔离形成的非同步分化模式与不对称基因流特征，包含3个归档文件。 文件详解 归档文件1：MarTum-fsc2_files.tgz 文件格式：TGZ...
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WikiPathways_201906_人类通路GPML与RDF数据
数据集概述 本数据集为WikiPathways 2019年6月发布的人类通路数据，包含人类GPML文件及GPMLRDF、WPRDF格式的转换文件，采用CCZero协议开放获取，共4个文件，无目录结构。 文件详解 文件名称：wikipathways-20190610-gpml-Homo_sapiens.zip 文件格式：ZIP...
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真核生物启动子数据库_EPDnew_2023年11月FTP目录快照数据
数据集概述 本数据集是2023年11月EPDnew FTP目录的快照。EPDnew指2013年起发布的新版真核生物启动子数据库，包含2013年以来发布的15种模式生物的所有数据库版本。数据集以单个压缩文件形式呈现，记录了目录的完整结构和内容。 文件详解 文件名称：epdnew-ftp-2023.11.zip 文件格式：ZIP...
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NCBA_BosT1_0_Project_Based_代码与数据_存档
数据集概述 本数据集包含NCBA_BosT1.0项目中用于生成图表的全部代码与数据，以压缩包形式存储，无目录层级结构，未划分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理数据集，可支持项目相关图表的复现与验证。 文件详解 压缩包文件 文件名称：cattleGenome-main.zip 文件格式：ZIP...
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Common_gardens_Metadata_文献综述元数据_2021
数据集概述 本数据集为Common gardens文献综述的元数据，聚焦互惠移植实验（进化生物学中检测种群本地适应性的金标准），涵盖草种早期研究到基因组时代的进展，分析实验设计局限与优化方向，探讨结合基因组学和群落环境的研究潜力，支持本地适应性、气候变化响应及恢复实践研究。 文件详解...
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PCaWGS_GitHub_Source_前列腺癌细胞系过滤注释变异数据
数据集概述 本数据集包含PC3和LNCaP人前列腺癌细胞系的过滤注释单核苷酸变异（SNV）和短插入缺失（indel）变异数据。通过Illumina HiSeqX测序，经比对、变异检测、公共数据库过滤及SnpEff注释处理，区分细胞系特有及共享变异，共3个压缩文件。 文件详解 LNCaP-private-0001.vcf.snpeff.zip...
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PLOSone_同源基因对系统发育基因组学影响_环节动物亲缘关系研究数据
数据集概述 本数据集为《同源基因对系统发育基因组学研究的影响——以环节动物亲缘关系为例》研究的配套数据，包含用于环节动物系统发育分析的串联数据集与单分区数据集，涉及同源基因错误分组对系统发育重建结果的影响验证，支持相关生物信息学分析。 文件详解 README_for_Struck_PLOSone2013.txt 文件格式：TXT...
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Aculeata_Based_社会复杂性梯度可变剪接进化分化补充表格数据
数据集概述 本数据集为支持Aculeata昆虫社会复杂性梯度可变剪接进化分化研究的补充表格，包含一份Excel文件，记录相关研究的结构化数据，用于昆虫进化生物学领域的分析与验证。 文件详解 文件名称：SupplementaryTable.xlsx 文件格式：XLSX...
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Plethodon_Based_基因组大小驱动器官特异性形态演化研究数据
数据集概述 本数据集围绕蝾螈属（Plethodon）9个物种的基因组大小与器官形态演化关系展开，包含基因组大小、器官形态测量数据、系统发育树及原始数据等，用于验证基因组大小对心脏和肝脏组织结构的影响，共5个文件。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、实验方法及文件说明等内容...
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Chorus_Generated_羽扇豆物种比较作图寡核苷酸探针列表数据
数据集概述 本数据集包含通过Chorus软件生成的寡核苷酸探针列表，筛选后的探针用于羽扇豆物种的oligo-FISH比较作图研究。数据内容与论文《The puzzling fate of a lupin chromosome revealed by reciprocal oligo-FISH and BAC-FISH...
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Ant_Agriculture_Based_蚂蚁农业进化与真菌驯化研究数据
数据集概述 本数据集围绕蚂蚁农业进化研究展开，包含支持“走出雨林”假说及真菌驯化环境分析的相关数据。通过基因组学数据重建真菌种植蚂蚁的进化史，探究农业系统、栖息地偏好与生物地理的演化历程，共包含八个文件，以压缩包为主。 文件详解 生物地理与性状多样化文件（biogeo-trait-diversification-files.zip） 文件格式：ZIP...
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Dryad_Based_外显子捕获系统发育基因组学蜥蜴演化研究数据2015
数据集概述 本数据集为外显子捕获系统发育基因组学研究相关数据，针对澳大利亚石龙子蜥蜴（冠群年龄约8000万年）开展，使用目标富集技术测序约3000个蛋白编码外显子，研究不同系统发育分化水平下目标基因座的富集效率，同时开发了低至中等分化样本的分析工作流程。 文件详解 README_for_dryad_34274.zip.txt 文件格式：TXT...
