数据集概述
本数据集为WikiPathways 2019年6月发布的人类通路数据,包含人类GPML文件及GPMLRDF、WPRDF格式的转换文件,采用CCZero协议开放获取,共4个文件,无目录结构。
文件详解
- 文件名称:wikipathways-20190610-gpml-Homo_sapiens.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含人类通路的GPML格式原始文件
- 文件名称:wikipathways-20190610-rdf-void.ttl
- 文件格式:TTL
- 字段映射介绍:RDF格式的VOID描述文件
- 文件名称:wikipathways-20190610-rdf-gpml.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:GPML文件转换后的RDF格式文件压缩包
- 文件名称:wikipathways-20190610-rdf-wp.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:WikiPathways通路数据的RDF格式文件压缩包
数据来源
WikiPathways
适用场景
- 生物信息学研究: 用于分析人类通路的结构与功能,支持基因组学、蛋白质组学等多组学数据整合
- 通路数据库构建: 作为通路数据来源,用于构建或补充生物通路数据库
- 语义网应用: 利用RDF格式数据开展生物医学领域的语义网研究与应用
- 数据标准化转换: 研究GPML与RDF格式之间的转换规则与数据映射关系