数据集概述
本数据集包含PC3和LNCaP人前列腺癌细胞系的过滤注释单核苷酸变异（SNV）和短插入缺失（indel）变异数据。通过Illumina HiSeqX测序，经比对、变异检测、公共数据库过滤及SnpEff注释处理，区分细胞系特有及共享变异，共3个压缩文件。
文件详解
- LNCaP-private-0001.vcf.snpeff.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：LNCaP细胞系特有的过滤注释变异VCF文件压缩包
- PC3-private-0000.vcf.snpeff.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：PC3细胞系特有的过滤注释变异VCF文件压缩包
- PC3-LNCaP-shared-0002.vcf.snpeff.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：PC3和LNCaP细胞系共享的过滤注释变异VCF文件压缩包
数据来源
GitHub仓库https://github.com/sciseim/PCaWGS
适用场景
- 前列腺癌基因组变异研究：分析PC3和LNCaP细胞系的特有及共享变异特征
- 癌症细胞系分子标记开发：识别可用于细胞系鉴定的特异性变异位点
- 肿瘤遗传学机制研究：探索变异与前列腺癌细胞系生物学特性的关联
- 癌症精准医疗研究：为前列腺癌靶向治疗靶点筛选提供变异数据支持
- 生物信息学变异分析方法验证：作为标准数据集测试变异检测及注释流程
