找到96个数据集

标签: 基因组序列

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  • FISH_Based_欧洲玉米螟染色体图谱与亚洲玉米螟基因组数据

    2026年1月28日   

    数据集概述 本数据集围绕鳞翅目昆虫染色体组织保守性展开,包含欧洲玉米螟(Ostrinia nubilalis)的FISH染色体图谱构建数据,以及亚洲玉米螟(Ostrinia furnacalis)的511 Mb基因组序列,用于探究家蚕(Bombyx mori)染色体融合事件的边界区域,支持鳞翅目染色体进化研究。 文件详解 文件名称:O....
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  • HiBC_Based人类肠道细菌基因组序列数据集20240717

    2026年1月28日   

    数据集概述 本数据集为人类肠道细菌集合(HiBC)的基因组序列数据,包含从人类肠道分离的细菌菌株的16S rRNA基因序列、基因组序列及培养条件,涵盖已知细菌及新物种菌株,定期更新。本次提供的是FASTA核苷酸格式的基因组序列压缩包,质粒序列位于文件末尾,已修正前期错误及分类学拼写问题。 文件详解...
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  • Ficus_Based_雌雄异株榕属植物传粉者共享基因组序列数据

    2026年1月28日   

    数据集概述 本数据集包含雌雄异株榕属植物与榕小蜂的基因组序列数据,用于研究两者间的物种特异性及传粉者共享机制。通过基因组测序、线粒体DNA序列及微卫星数据分析,探究台湾三种榕小蜂的基因分化与传粉行为,为协同进化理论提供实证支持。 文件详解 压缩文件(Archive files) 文件名称:t50.zip、t100.zip 文件格式:ZIP...
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  • RevBayes_Based_多态感知物种树与进化力估计补充数据

    2026年1月28日   

    数据集概述 本数据集为论文《Polymorphism-aware estimation of species trees and evolutionary forces from genomic sequences with...
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  • Caribbean_Based_加勒比红树林繁殖体扩散差异研究数据

    2026年1月27日   

    数据集概述 本数据集围绕加勒比地区两种红树林(白红树Laguncularia racemosa与红树Rhizophora mangle)的繁殖体扩散差异展开,包含叶绿体基因组、核标记序列、海洋洋流数据及补充文档,用于研究海漂适应性陆生植物的遗传变异地理分布机制,涉及基因流、洋流影响等关键问题。 文件详解 基因组序列文件(.fasta格式)...
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  • Genomes_and_models_居民群落与病原体基因组模型数据

    2026年1月27日   

    数据集概述 本数据集包含居民群落与病原体的基因组序列及模型文件,共12个文件,涵盖.fna和.xml两种格式,各占50%。文件以QL编号命名,包含基因组序列数据和对应的元数据信息,为生物信息学研究提供基础数据支持。 文件详解 .fna格式文件(共6个) 文件名称示例:QL-117.fna、QL-A3.fna、QL-Rs1115.fna...
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  • Zymoseptoria_Based_植物病原体属基因组组装与注释数据

    2026年1月26日   

    数据集概述 本数据集包含论文“Genome compartmentalization predates species divergence in the plant pathogen genus...
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  • Mvit_genome_Based_无脊椎动物基因组序列与注释数据集

    2026年1月25日   

    数据集概述 本数据集包含Mvit物种(推测为某种无脊椎动物)的基因组相关数据,共7个文件,涵盖基因组序列、注释信息、比较分析结果等内容,支持基因组结构分析、功能基因挖掘及进化研究。 文件详解 基因组序列文件...
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  • PhytoKeys_补充材料1_海京科属系统基因组学研究补充材料数据

    2026年1月23日   

    数据集概述 本数据集为Heliconia属系统基因组学研究的补充材料,包含系统基因组学分析所需的标本信息、基因组序列数据及登录号。数据支撑对热带Heliconia属的分类学研究,共含一个文件,是该属分类修订与系统发育分析的重要参考资料。 文件详解 文件名称:oo_1218765.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • SARS_CoV_2_Based_疫苗突破性感染中和免疫研究分析数据

    2026年1月23日   

    数据集概述 本数据集包含支持论文《Neutralizing immunity in vaccine breakthrough infections from the SARS-CoV-2 Omicron and Delta...
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  • 俄勒冈生物多样性基因组项目_俄勒冈淡水鱼类有丝分裂基因组参考数据库数据

    2026年1月23日   

    数据集概述 本数据集为俄勒冈生物多样性基因组项目的成果,包含俄勒冈州129种淡水鱼类共313个样本的完整有丝分裂基因组序列。数据用于构建区域基因组参考数据库,解决eDNA监测中物种识别的瓶颈问题,分析线粒体条形码区域的局限性及基因间区域的应用潜力,为生物多样性监测提供技术蓝图。 文件详解...
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  • CRAB_基于基因组学的AMPSUL_CAZAVI联合用药机制模型数据

    2026年1月22日   

    数据集概述 本数据集包含针对产金属β-内酰胺酶的碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌(CRAB)的抗生素联合用药研究数据,涉及AMP/SUL与CAZ/AVI联合用药的药效动力学分析、机制模型构建及菌株基因组信息,支持耐药菌治疗策略的研究。 文件详解 AMA133.fasta 文件格式:FASTA...
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  • Leavenworthia_alabamica_SC选择_基因组序列数据

    2026年1月21日   

    数据集概述 本数据集聚焦植物Leavenworthia alabamica自交亲和性(SC)的近期选择机制,包含其S-基因座周围约690Kb区域及非连锁区域的序列数据,用于检测S-基因座的近期正选择信号,分析多态性与位点频率谱,为植物从异交到自交的进化转变研究提供基因组层面证据。 文件详解 a2_pseudoS_genome_2chroms.txt...
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  • orderedPainting_Based_细菌基因组重组热区高效推断数据

    2026年1月21日   

    数据集概述 本数据集为细菌基因组重组热区推断研究相关数据,基于有序染色算法开发的计算高效方法,识别细菌基因组中DNA频繁转移的“热区”。数据支持分析大肠杆菌和空肠弯曲菌基因组的重组事件,为空肠弯曲菌200个基因组分析结果,可用于原核生物群体基因组重组研究。 文件详解 文件名称:jejuni200_data.zip 文件格式:ZIP...
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  • AcMNPV_Based_大型双链DNA病毒基因组结构变异与转座元件研究数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集围绕大型双链DNA病毒基因组结构变异展开研究,通过短读长(Illumina)和长读长(PacBio)测序技术分析AcMNPV病毒基因组,识别出1141个结构变异(SVs)及1757个转座元件插入,并扩展验证了虹彩病毒和疱疹病毒的SV特征,揭示了SV在病毒种群中的动态演化规律。 文件详解 基因组序列与注释文件...
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  • Gilbert_2024_ARW_Pond_Study宏基因组组装基因组数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集为Gilbert团队2024年ARW池塘微生物组研究使用的宏基因组组装基因组(MAG)数据,包含一个压缩文件,整合了所有MAG组装结果,用于支持池塘微生物群落的基因组分析研究。 文件详解 文件名称:ARW1_ARW7_MAG_assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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  • iwc_Based_iwc工作流Bionano_VGP7基因组组装测试数据集

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集为iwc工作流的测试数据,用于支持Bionano VGP7技术的基因组组装(Scaffolding)流程验证。包含基因组组装所需的输入文件、参数配置文件及Bionano数据文件,共3个文件,覆盖.gfa1、.json、.cmap三种格式。 文件详解 输入GFA文件 文件名称:Input GFA.gfa1 文件格式:.gfa1...
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  • Phylogenomic_Wolbachia_菌株基因组进化与重组研究数据集

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集包含Wolbachia菌株的系统发育基因组分析相关数据,涵盖33个基因组测序菌株的核心基因鉴定、系统发育关系验证、重组事件筛查及MLST与全基因组 divergence 相关性分析结果,支撑对该菌基因组进化与重组模式的研究。 文件详解 数据文件(Excel格式) 文件名称:DataS1.xlsx、DataS6.xlsx...
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  • Treponema_primita_Source_硒与翻译解偶联转录调控数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集围绕白蚁肠道共生菌Treponema primita展开,探究硒元素及翻译解偶联对其全基因组转录的调控机制。包含4个文件,覆盖硒充足、硒限制及四环素处理条件下的转录组数据,以及该菌的基因组序列文件,为研究细菌转录与翻译偶联调控提供基础数据。 文件详解 plus_tet.zip 文件格式:ZIP...
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  • Illumina_NGST_Based_从头物种多基因家族测序与组装方法数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集基于Illumina下一代测序技术(NGST),针对无参考基因组的从头物种,对哺乳动物最大的多基因家族——嗅觉受体(Olfactory Receptor)基因家族进行扩增与测序。结合传统实验室方法与新型组装技术,实现数据注释与过滤,可应用于任意基因家族或物种。数据集包含38个文件,涵盖测序数据、质控脚本、引物文件及说明文档等。...
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