数据集概述
本数据集包含支持论文《Neutralizing immunity in vaccine breakthrough infections from the SARS-CoV-2 Omicron and Delta variants》分析的脚本与元数据，共8个文件。内容覆盖统计分析脚本、可视化代码、血清学补充表格及基因组序列文件，用于研究Omicron和Delta变异株疫苗突破性感染中的中和免疫特性。
文件详解
- 统计分析脚本（.r格式）
- 文件名称：mannWhitney.R、wilcoxonSignedRank.R、regression.R、spearmanCorr.R
- 文件格式：R脚本
- 字段映射介绍：包含用于执行Mann-Whitney检验、Wilcoxon符号秩检验、回归分析及Spearman相关性分析的代码逻辑
- 可视化代码（.ipynb格式）
- 文件名称：plotKDE.ipynb、plotCDF.ipynb
- 文件格式：Jupyter Notebook
- 字段映射介绍：用于生成核密度估计（KDE）和累积分布函数（CDF）可视化的代码
- 血清学数据文件（.xlsx格式）
- 文件名称：SupplementaryTable1_serology_v6.xlsx
- 文件格式：Excel表格
- 字段映射介绍：包含血清学相关的补充表格数据，具体字段未提供预览
- 基因组序列文件（.fa格式）
- 文件名称：serology-genomes.fa
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含与血清学分析相关的SARS-CoV-2基因组序列数据
数据来源
论文《Neutralizing immunity in vaccine breakthrough infections from the SARS-CoV-2 Omicron and Delta variants》
适用场景
- 疫苗免疫效果评估: 分析Omicron和Delta变异株疫苗突破性感染中的中和抗体水平及免疫特性
- 统计方法应用研究: 验证Mann-Whitney检验、Wilcoxon符号秩检验等非参数统计方法在免疫数据中的适用性
- 免疫数据可视化: 利用KDE和CDF可视化方法展示中和免疫数据的分布特征
- 基因组与免疫相关性分析: 探索SARS-CoV-2基因组序列与血清学免疫指标的关联
- 医学研究可重复性验证: 为相关研究提供标准化分析脚本与元数据支持
