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Memecylon_Based_植物演化与生物地理学研究数据集
数据集概述 本数据集围绕Memecylon属（野牡丹科）的演化与生物地理学研究展开，包含通过目标捕获技术获取的67个Memecylon类群的基因组数据，支持系统发育分析、分化时间估算、生物地理历史重建及形态特征演化研究，共7个相关文件。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX...
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Data_Based蚊子基因内含子含量与密码子使用偏好研究数据
数据集概述 本数据集围绕三种蚊子物种基因的内含子含量与密码子使用偏好的拮抗关系展开，包含相关研究的核心数据。通过分析同源基因在系统发育背景下的特征，探究其功能与进化意义，为蚊子基因组生物学及病媒传播疾病防控策略研究提供支持。 文件详解 文件名称：DATA.xlsx 文件格式：XLSX...
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Drosophila_Based_细尺度重组率遗传进化关联数据
数据集概述 本数据集包含果蝇（Drosophila persimilis）两条主要染色体细尺度重组率的遗传进化关联研究数据。通过181个SNP标记构建重组率图谱，分析局部重组率异质性、与重复元件及序列基序的关联、交叉干扰范围，以及与姊妹种重组率的相关性，探讨重组率与核苷酸多样性、GC含量的关系，支持选择模型和GC偏向基因转换模型。 文件详解...
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UCE_Based_新热带界雨林鸟类超保守元件基因测序研究数据
数据集概述 本数据集为浅进化时间尺度比较研究的超保守元件（UCEs）目标捕获与大规模平行测序数据，包含5种新热带界雨林鸟类的776-1516个UCE位点，53-77%位点具多态性，平均每个多态位点含2.0-3.2个可变位点，可用于物种树构建、溯祖建模及物种界定等分析。 文件详解 主数据压缩包 文件名称：full.zip 文件格式：ZIP...
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Rye_Reference_NLRome_黑麦抗性基因注释数据
数据集概述 本数据集包含对近期发布的黑麦（Rye）参考基因组'Lo7'和'Weining'中核苷酸结合富亮氨酸重复序列（NB-LRR或NLR，主要抗性基因家族）的注释信息。旨在为黑麦NLRome的进一步研究及新型抗病品种选育提供有价值且易于获取的资源，共包含3个文件。 文件详解 文件名称：Lo7_NLRome_NB-ARC.fasta...
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Pisum_sativum_Based豌豆基因组转录因子数据集
数据集概述 本数据集包含豌豆（Pisum sativum）基因组中的转录因子（TF）信息，分为两个表格：Table 1记录1807个转录因子的家族预测及与蒺藜苜蓿、拟南芥的BlastP比对结果；Table 2整理豌豆、蒺藜苜蓿和拟南芥转录因子的基因标识、家族预测及描述。数据来自PlantTFDB和对应基因组注释，共1个文件。 文件详解...
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FISH_Based_欧洲玉米螟染色体图谱与亚洲玉米螟基因组数据
数据集概述 本数据集围绕鳞翅目昆虫染色体组织保守性展开，包含欧洲玉米螟（Ostrinia nubilalis）的FISH染色体图谱构建数据，以及亚洲玉米螟（Ostrinia furnacalis）的511 Mb基因组序列，用于探究家蚕（Bombyx mori）染色体融合事件的边界区域，支持鳞翅目染色体进化研究。 文件详解 文件名称：O....
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Tetrix_japonica_转录组测序_日本蚱蜢基因资源数据
数据集概述 本数据集为日本蚱蜢（Tetrix japonica）的从头转录组测序与分析结果，包含成虫和幼虫样本的转录组数据。通过Illumina HiSeq...
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Enrichment_dram1突变斑马鱼幼虫基因集富集分析数据
数据集概述 本数据集用于分析dram1突变斑马鱼幼虫中基因集的富集情况，包含基因本体论分类的显著差异以及与MSigDB C2数据库基因集的相关关系，为研究dram1基因功能提供基因表达层面的参考。 文件详解 文件名称：Table S1.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：文件包含三组核心分析内容的表格数据：...
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Genomic_comparison_海草物种基因组特征研究数据
数据集概述 本数据集包含两种海草物种的基因组比较结果表格，源自澳大利亚昆士兰大学未发表的博士论文，论文主题为两次独立重返海洋事件中海草物种的基因组特征研究。数据涵盖基因保守性、缺失情况及OGCZ基因等三类核心内容。 文件详解 文件名称：Conserved_in_seagrass.xlsx 文件格式：XLSX...
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Sceloporus_Based_北美刺蜥物种分化比较基因组数据
数据集概述 本数据集为北美刺蜥属8个物种三元组的基因组分化研究数据，通过简化基因组测序获取数百个基因座序列，使用隔离-迁移模型对比物种分化的遗传历史，检测物种形成时的基因流情况，分析基因组水平的分化时间变异及迁移率参数。 文件详解 文件名称：TripletData.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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KITLG_Based巴基斯坦山羊品种毛色模式基因组关联研究数据
数据集概述 本数据集为巴基斯坦两个山羊品种毛色模式的基因组分析研究数据，通过GoatSNP50芯片对35只具花斑（roan）毛色的山羊（A组）与740只无该毛色的山羊（B组）进行基因分型，结合纯合子运行（ROH）和XP-EHH分析，识别出3个潜在关联基因组区域，其中5号染色体上含KITLG基因的区域差异最显著，支持该基因与山羊花斑毛色相关的假设。...
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Vertebrate_脊椎动物基因家族系统发育树数据集_2002
数据集概述 本数据集包含118个脊椎动物基因家族的系统发育树，用于James Cotton和Roderic Page在2002年发表的两篇论文。数据涵盖基因序列文件、系统发育树文件、分类重叠图及基因家族列表，支持基因进化关系与分类学分析。 文件详解 压缩包文件 文件名称：genes.zip 文件格式：ZIP...
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AMY1_AMY2_意大利马品种唾液与胰腺α_淀粉酶基因变异数据
数据集概述 本数据集围绕意大利马品种的唾液α-淀粉酶基因（AMY1）和胰腺α-淀粉酶基因（AMY2）展开研究，包含7个新发现的单核苷酸多态性（SNP），其中3个位于外显子区域，并对6个品种的112匹马进行了基因分型，分析不同营养管理历史品种间的基因多态性差异。 文件详解 文件名称：SNP_genotyping.xlsx 文件格式：XLSX...
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Anammox_微生物基因组研究_厌氧氨氧化细菌电子受体补充数据
数据集概述 本数据集是关于厌氧氨氧化（anammox）细菌电子受体研究的补充数据，包含2个Excel补充表格和1个宏基因组氨基酸序列文件。研究聚焦于厌氧氨氧化细菌最初以一氧化氮（NO）为电子受体的假设，通过比较基因组学分析了相关基因的水平转移，并验证了菌群的代谢活性，为理解厌氧氨氧化细菌的进化和代谢机制提供支持。 文件详解...
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Symphonia_Based热带树种基因组工具开发及遗传标记数据
数据集概述 本数据集包含热带树种Symphonia globulifera的基因组工具开发成果，包括首个低覆盖度（11X）基因组草图、单核苷酸多态性（SNP）及简单序列重复（SSR）标记数据。数据覆盖该树种67.5%的预估基因组大小，含基因注释、SSR标记及跨地理种群的遗传多态性信息，可支持种群遗传学及比较基因组学研究。 文件详解...
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Dryad_Vera_et_al_欧洲入侵食蚊鱼基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集基于限制性位点相关DNA标签（RADtags）技术，对比美国本土与欧洲入侵食蚊鱼（Gambusia holbrooki）种群的基因组变化，分析其入侵过程中的进化机制。筛选后保留7724个含单个SNP的RADtags，其中186个匹配近缘物种（Xyphophorus...
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WAP65_HPX_Based鱼类与哺乳动物基因适应性进化分析数据
数据集概述 本数据集围绕鱼类暖温适应相关蛋白（WAP65）及其哺乳动物同源物血红素结合蛋白（HPX）的适应性功能分化展开，包含系统发育树、序列比对、选择压力分析等5类压缩文件，支持基因进化动力学、蛋白质功能差异及三维结构的研究。 文件详解 系统发育树文件 文件名称：PhylogeneticTree.zip 文件格式：ZIP...
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Apoptosis_Network_Based祖先凋亡网络进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕祖先凋亡网络的复杂性展开，基于对刺胞动物、线虫、昆虫、海胆、文昌鱼等无脊椎动物基因组的分析，揭示凋亡相关蛋白家族（如Apaf-1、Bcl-2、caspase）的进化历程，包括祖先多 paralog 现象、线虫/昆虫的基因丢失及脊椎动物的扩张，挑战了简单祖先网络的传统范式。 文件详解 序列与比对文件...
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OGRDB_Based_小鼠MSM_MsJ品系IGH受体胚系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠MSM/MsJ品系的IGH受体胚系参考集，发布于开放胚系受体数据库（OGRDB）。包含4个文件，涵盖胚系序列的带间隙、无间隙fasta文件、json格式数据及许可文件，支持免疫遗传学领域对小鼠IGH受体胚系序列的研究与应用。 文件详解 数据文件 文件名称：MsJ IGH_rev_1_gapped.fasta...
