数据集 - 海数据

EnzymeMap_v2_brenda2023_酶促反应数据_生物化学_机器学习数据

2026年1月18日

数据集概述本数据集包含按EC编号分类的原子映射、平衡酶促反应数据，以及用于训练IBM RXN-for-Chemistry平台Transformer模型的原始未映射数据。数据来源于BRENDA 2023-1版本，经提取、修正和整理，适用于机器学习模型预测酶促反应或生物逆合成。数据集包含3个文件，以压缩格式和JSON格式存储。文件详解酶促反应数据文件...

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辉瑞公司_Pharmacia_补充材料_咪达唑仑酮衍生物奥罗拉激酶抑制剂药物研发数据_2023年

2026年1月11日

数据集概述本数据集是论文《Lead drug discovery from imidazolinone derivatives with Aurora kinase inhibitors》的补充材料，包含1份文档文件，用于支持论文中关于咪唑啉酮衍生物作为Aurora激酶抑制剂的先导药物发现研究。文件详解文件名称：oo_954193.docx...

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DEKOIS2_0_for_KarmaDock_虚拟筛选目标蛋白与化合物库数据集

2026年1月15日

数据集概述本数据集为DEKOIS 2.0版本，用于虚拟筛选任务。针对每个目标，提供蛋白质结构PDB文件、化合物库SMILES文件及Glide对接构象，以压缩包形式存储，支持药物发现领域的虚拟筛选研究。文件详解文件名称：DEKOIS2.zip 文件格式：ZIP...

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Boesenbergia_pandurata_Based_抗乳腺癌活性分子筛选研究数据

2026年1月14日

数据集概述本数据集基于Boesenbergia pandurata（手指姜）抗乳腺癌研究，包含其代谢物对ER-α和HER2受体的分子对接结果，以及对筛选出的候选代谢物的ADMET（吸收、分布、代谢、排泄、毒性）特性分析数据，旨在识别潜在的抗乳腺癌活性代谢物。文件详解文件名称：Hasil ADMET(AutoRecovered).xlsx...

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Enamine_Source_SARS_CoV_2_RdRP靶点虚拟筛选与活性验证数据

2026年1月14日

数据集概述本数据集记录了针对SARS-CoV-2 RdRP靶点的Enamine REAL数据库虚拟筛选结果及后续VeroE6细胞抗新冠病毒活性验证的关键信息，是抗新冠病毒药物发现的重要参考数据，包含1个文件。文件详解文件名称：Virtual screening of the Enamine REAL database against SARS-...

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QSAR_Based_2_氨基噻唑_4_5H_酮衍生物_11β_HSD1抑制剂建模数据

2026年1月14日

数据集概述本数据集支持关于新型2-氨基噻唑-4(5H)-酮衍生物作为11β-HSD1抑制剂的计算QSAR研究论文，包含56个合成衍生物的分子结构、描述符值及实验抑制活性，以及39个新设计类似物的结构和描述符值，用于确保QSAR模型可重复性，助力药物发现相关研究。文件详解 .mol文件（95个）文件名称：如3b.mol、1a.mol等...

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TRPV6_Based_天然产物启发的选择性TRPV6钙通道抑制剂优化研究数据_2020

2026年1月13日

数据集概述本数据集围绕天然产物启发的选择性TRPV6钙通道抑制剂优化研究展开，包含相关实验或研究数据，为药物研发领域提供TRPV6钙通道抑制剂优化的参考信息，数据集共含一个文件。文件详解文件名称：Cunha et al_2020.xlsx 文件格式：XLSX...

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MALDI_TOF_MS_PhenoMS_ML_质谱机器学习抗菌表型筛选研究数据2020

2026年1月13日

数据集概述本数据集为论文《Machine learning in mass spectrometry: A MALDI-TOF MS approach to phenotypic antibacterial screening》的配套数据，包含基于MALDI-...

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Leishmanial_Psidium_guajava代谢组学抗利什曼原虫化合物研究数据

2026年1月13日

数据集概述本数据集是基于代谢组学方法从番石榴（Psidium guajava L.）中分离抗利什曼原虫化合物的研究数据。利什曼病年发病率约一百万例，现有治疗存在副作用等问题，本研究通过液相色谱-高分辨质谱分析不同产地番石榴叶粗提物，结合多变量相关分析筛选活性化合物，包含处理后数据集及原始数据。文件详解文件名称：LCMS-MSDial-...

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GLP_1R_VS_Based_基于SBVS和LBVS的化合物识别列表数据20210426

2026年1月13日

数据集概述本数据集包含通过SBVS（基于结构的虚拟筛选）和LBVS（基于配体的虚拟筛选）两种方法识别的化合物列表，分为两个补充表格，总计收录87种化合物，是药物发现领域虚拟筛选研究的关键数据参考。文件详解文件名称：GLP-1R-VS-20210426 SI.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含两个表格文件： Table...

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ThesisDataset_RNA_binders_Based_化学信息学RNA结合配体分类数据集_2024

2025年12月28日

数据集概述本数据集为Ing. Jozef Fülöp（布拉格化工学院，2024）的硕士论文“Cheminformatics Analysis of RNA-Binding Ligands”相关数据，包含RNA结合分子分类的原始及处理数据，分为Set1 Large（77,420个化合物）和Set2...

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ASB_Scaffolds_Shared_between_ZINC_ChEMBL_and_PubChem数据集

2025年12月28日

数据集概述本数据集提供ZINC与ChEMBL（22版）、ZINC与PubChem以及三个数据库共有的基于类似物系列（ASB）的支架化合物信息，包含三个独立数据文件及一个说明文档，总计四个文件。数据记录了ASB支架对应的ZINC化合物SMILES表示、化合物数量、注释靶点数量及列表，可用于药物发现相关研究。文件详解 README.docx...

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GraphDTA事后分析脚本数据集

2025年12月23日

数据集概述该数据集包含用于复现GraphDTA论文事后分析的脚本文件，以压缩包形式存储，为验证或扩展相关研究提供工具支持。文件详解文件名称：GraphDTA-post-hoc.zip 文件格式：ZIP（.zip）内容说明：压缩包内包含复现GraphDTA论文事后分析所需的脚本文件，具体脚本内容需解压后查看适用场景...

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chemoinformatics与计算药物化学数据集

2025年12月22日

数据集概述本数据集是实验室开发的免费注释化合物数据集与软件工具的一部分，用于 chemoinformatics 与计算药物化学领域。原始版本已发表，更新版本将在后续数据笔记中说明，提供相关研究的数据支持。文件详解文件类型：均为.zip格式，共32个压缩文件...

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单模板配体法发现小分子核酸结合剂评估数据集

2025年12月22日

数据集概述该数据集包含16种分子指纹与6种单模板配体虚拟筛选方法的基准测试结果，针对多组DNA/RNA配体数据，涵盖性能指标、统计分析及评估代码，用于核酸靶向药物发现的分子指纹与相似性度量研究。文件详解文件名称: filipsPL/rna-ligand-based-0.2.2.zip 文件格式: ZIP（压缩文件）内容说明:...

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ABCD化学子结构搜索SMARTS查询数据集

2025年12月22日

数据集概述该数据集包含来自《ABCD化学子结构搜索SMARTS查询》论文表2的四十六条SMARTS查询，用于大型化学库的高效子结构搜索。数据集提供原始表格PDF、包含概述、表数据及ID映射的电子表格，以及详细说明文档，支持化学信息学领域的子结构搜索研究与应用。文件详解文档文件：...

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PDBQT_1_0_0_Based_分子结构研究完整数据

2025年12月20日

数据集概述该数据集为PDBQT v1.0.0版本，包含62个文件，无目录层级。核心文件为58个.pdbqt格式的分子结构文件，涵盖多种化合物，同时包含图片、文档及应用程序文件，为分子结构相关研究提供数据支持。文件详解核心分子结构文件（.pdbqt格式，共58个）：...

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GNN_Trained_Models_Based_图神经网络模型训练完整数据

2025年12月20日

数据集概述本数据集包含在特定目标和数据集上训练的图神经网络（GNN）模型文件，涉及Sun等人数据集（目标为AR、ER、ED）和Tox21数据集（基于旧版本训练），使用Chemprp 1.x工具训练，以压缩包形式存储。文件详解文件名称: dmpnn_trained_models.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip）内容说明:...