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Pregnancy_Glut2_妊娠小鼠胰岛β细胞质量变化研究数据
数据集概述 本数据集来自妊娠小鼠胰岛β细胞质量变化研究,聚焦Ins+Glut2LO细胞对妊娠期间β细胞质量扩张的贡献。通过对不同妊娠天数及产后小鼠胰腺的免疫组化和显微镜观察,分析β细胞质量、增殖及Ins+Glut2LO细胞比例变化,为妊娠期糖尿病发病机制研究提供实验依据。 文件详解 文件名称:GTT.pzf 文件格式:.pzf...
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Haberlea_Based耐脱水植物黑暗适应基因表达研究数据2018
数据集概述 本数据集记录耐脱水植物Haberlea rhodopensis在30天黑暗处理及复光后的基因表达与代谢变化,探究其适应长期黑暗的分子机制。植物在黑暗中保持绿色存活,转录组分析显示黑暗调控转录因子、自噬相关基因及SnRK1信号通路等表达,代谢组分析揭示氨基酸、脂质等物质变化,支持其黑暗适应策略研究。 文件详解 文件名称:Haberlea...
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数据4D_Single_Cell_胚胎发生时空模式转录因子蛋白图谱数据集
数据集概述 本数据集为胚胎发生过程中转录因子(TF)的4D单细胞蛋白图谱数据,记录各TF报告株在追踪细胞不同时间点的原始与处理后表达信息,用于揭示胚胎发育的时空模式,包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称:Time_series_expression_dataset.zip 文件格式:ZIP...
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Drosophila_Odd_paired_分节频率加倍调控网络研究数据
数据集概述 本数据集聚焦果蝇分节过程中Odd-paired(Opa/Zic)转录因子调控配对规则基因网络实现频率加倍的机制研究,包含双荧光原位杂交图像数据及说明文档,助力解析果蝇前后轴模式形成的关键调控网络动态变化。 文件详解 README文档 文件名称:README_for_Drosophila_PRG_double_FISH_data.rtf...
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TF_KO_ALE_Supplemental_Data_生物实验补充信息
数据集概述 本数据集为TF KO-ALE实验的补充数据,包含4个文件,涵盖基因突变表、ICA运行结果、生长影响信息及基因测序读深等内容,涉及基因、转录因子(TF)等生物学相关信息,可用于基因功能、转录调控等生物学研究场景。 文件详解 SF1_mutation_table_for_supplement.csv(CSV格式):包含Reference...
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Notch_Nodal_Based海胆多能祖细胞规范网络转录因子调控数据
数据集概述 本数据集包含海胆胚胎多能祖细胞(CPCs)规范网络的关键调控数据,聚焦Notch和Nodal信号对叉头因子foxY表达的控制机制。数据涵盖基因信息、扰动实验的原始数据及定量分析结果,涉及Cyclopamine处理的不同时间点,用于解析CPCs命运决定的调控层级。 文件详解 代码集信息文件 文件名称:CODESET-...
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HansenZechner_Based_启动子转录因子动态表现支持原始数据
数据集概述 本数据集包含支持“启动子根据转录因子环境呈现不同动态表现”研究的原始数据,以MAT文件存储,涵盖9个启动子的实验数据。数据分为原始数据(_size.mat)和处理后数据(…MSN2.mat、…YFP.mat),记录了单脉冲或多脉冲实验中细胞荧光信号、分子数量、脉冲参数等信息,可用于分析启动子对转录因子动态的解码机制。 文件详解...
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SPT_Zebrafish_斑马鱼发育过程TF_染色质关联与核体积变化研究数据
数据集概述 本数据集为斑马鱼胚胎发育过程中TF-染色质关联与核体积变化的单分子成像研究数据,包含mEos2-TBP和mEos2-Sox19b两种转录因子的结合动力学、结合分数等定量信息,以及核体积数据,用于揭示合子基因组激活(ZGA)阶段转录因子与染色质相互作用的演化机制。 文件详解 文档类文件(.txt格式,共10个)...
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Heterochromatin_Source_异染色质抑制着丝粒GCR研究数据
数据集概述 本数据集围绕异染色质对着丝粒区域染色体重排(GCRs)的抑制作用展开,基于裂殖酵母实验研究,涉及组蛋白H3K9甲基化、Clr4/Suv39甲基转移酶、HP1同源物及转录相关因子等关键因素,包含3个Excel文件,用于支持相关研究结论验证与分析。 文件详解 Okita2018_ChIP_data_2.xlsx 文件格式:XLSX...
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bioRxiv_Preprint_Hox蛋白选择性靶向染色质可及性研究补充表格数据
数据集概述 本数据集是bioRxiv预印本“Chromatin Accessibility Plays a Key Role in Selective Targeting of Hox Proteins”的补充表格,包含6个Excel文件,涵盖ChIP-...
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DRG_Transcriptional_Profiling_背根神经节神经元分子多样性数据
数据集概述 本数据集通过转录组分析研究背根神经节(DRG)感觉神经元的分子多样性。利用小鼠报告系和IB4标记纯化三类神经元,结合单细胞qRT-PCR分析,揭示其离子通道、转录因子等分子表达模式及亚群分类,为躯体感觉神经元分子特征研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:Supplementary File 1.xlsx 文件格式:XLSX...
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TFM_Explorer_Source_Nelore牛体重增长与嫩度遗传关联研究补充材料数据
数据集概述 本数据集为Nelore牛体重增长与嫩度遗传关联研究的补充材料,包含3份文件,涉及转录因子与候选基因的关联分析结果,以及剪切力(SF)和平均日增重(ADG)相关的生物学过程数据,可用于研究牛遗传性状的调控机制。 文件详解 文件名称:Table S1.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:TFM-...
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LappalainenLab_Based_转录因子调控网络细胞系特异性研究与疾病关联分析数据2024
数据集概述 本数据集包含Minaeva et al. 2024研究中使用的原始及处理后文件,覆盖40种常见细胞系,修订了调控网络构建流程,包含数据集统计、网络富集、基准测试、转录因子活性分析及疾病富集等多类结果文件,支持细胞特异性基因调控程序的探索。 文件详解 1-dataset_stats子目录...
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C_elegans_Based_年轻成年秀丽隐杆线虫物理基因互作数据库_补充信息
数据集概述 本数据集为论文“Gene Regulatory Network inference in long lived C.elegans reveals modular properties that are predictive of novel ageing...
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Kastetal_FOXP2_Based皮质神经元表达与发育调控研究数据集2019
数据集概述 本数据集聚焦转录因子FOXP2在哺乳动物胚胎前脑的神经元类型特异性表达模式,以及其对皮质组织发生的调控作用。通过基因敲除实验与分子分析,验证FOXP2在皮质发育中的实际功能,修正此前对其调控范围的认知,为神经发育机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:Kastetal_FullSubmission_Dataset041519.xlsx...
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Rana_arvalis_Based_蛙类C_EBP_1基因纬度梯度适应性研究数据
数据集概述 本数据集围绕沼蛙(Rana arvalis)C/EBP-1基因展开,涵盖德国至瑞典北部5个纬度梯度区域的遗传与表型数据,用于研究该转录因子在幼虫发育适应气候梯度中的遗传基础、选择压力及与表型变异的关联,包含基因分型、SNP数据和共同花园实验表型数据三类文件。 文件详解 C_EBP_genotypes_364_individuals.xlsx...
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Dryad_Source_Solanaceae科R2R3_MYB转录因子多样化研究数据
数据集概述 本数据集围绕茄科(Solanaceae)植物R2R3-MYB转录因子的多样化展开,包含基于4种茄科植物全基因组数据鉴定的559个R2R3-MYB基因信息,以及其与拟南芥同源基因的进化关系重建、功能多样性比较结果,支撑茄科转录因子家族进化及功能分化研究。 文件详解 文件名称:Dryad.zip 文件格式:ZIP...
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Immune_Genes_Based两种野生啮齿动物免疫基因编码序列与表达差异分析数据
数据集概述 本数据集围绕两种野生啮齿动物(黄颈鼠与 bank voles)的脾脏转录组展开,分析不同功能类别的免疫基因在编码序列和表达上的种间差异,涉及模式识别受体、信号转导蛋白、转录因子等四类免疫基因,探讨序列与表达差异的关联性及对免疫功能的影响。 文件详解 数据文件...



