TF_KO_ALE_Supplemental_Data_生物实验补充信息

数据集概述

本数据集为TF KO-ALE实验的补充数据,包含4个文件,涵盖基因突变表、ICA运行结果、生长影响信息及基因测序读深等内容,涉及基因、转录因子(TF)等生物学相关信息,可用于基因功能、转录调控等生物学研究场景。

文件详解

  • SF1_mutation_table_for_supplement.csv(CSV格式):包含Reference Seq、Position、Mutation Type、Sequence Change、Gene、Function、Product、GO Process、GO Component、Mut ID、Details等字段及多个样本列,记录基因突变相关信息。
  • SF2_TF_KALE_ICA_run_results.xlsx(XLSX格式):存储TF KO-ALE实验的ICA运行结果数据。
  • SF3_growth_impact_info.csv(CSV格式):包含Operons、z_score_growth_impact、genes_in_operons、promoting_TFs、inhibiting_TFs等字段,记录操纵子的生长影响及转录因子调控信息。
  • SF4_gene_sequencing_read_depths.xlsx(XLSX格式):记录基因测序读深相关数据。

适用场景

  • 基因功能研究:通过基因突变表分析基因变异类型及功能影响。
  • 转录调控分析:利用生长影响信息研究转录因子对基因表达的调控作用。
  • 生物信息学分析:基于ICA运行结果进行数据降维与模式识别研究。
  • 基因测序数据评估:通过测序读深数据评估基因测序质量及覆盖度。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 18.58 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
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