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整合鸟类虱子寄生虫的系统发育与群体遗传学进化数据
数据集概述 本数据集整合了寄生在新大陆地鸠身上的体虱全基因组序列的系统发育和种群遗传数据,用于分析寄生虫多样性的形成过程(如协同物种形成、宿主转换)。通过比较虱子与地鸠的系统发育关系,揭示了长期进化尺度下的系统发育一致性及宿主特异性,同时发现部分广食性虱子类群在种群水平上的生物地理结构。 文件详解 系统发育树文件(.tre、.tree、.trees)...
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埃塞俄比亚新发现的变色龙头部背视图数据_2021
数据集概述 本数据集为论文《埃塞俄比亚Trioceros affinis物种复合体的新变色龙》的补充材料3,包含埃塞俄比亚新发现变色龙的头部背视图相关文档,用于支持该物种的分类学研究与形态特征分析,共1个文件。 文件详解 文件名称:oo_518526.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:文档包含Trioceros...
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用于进化分析的新热带蝾螈基因组大小及生物体型数据
数据集概述 本数据集包含60种新热带区蝾螈的基因组大小(C值)、身体大小及生物学大小相关数据,旨在研究基因组大小与身体大小的进化关系。数据通过Feulgen图像分析密度测定法(FIAD)估算基因组大小,并结合系统发育背景分析生物学大小,发现物理身体大小与基因组大小存在显著相关性,且部分大型蝾螈的生物学大小小于微型物种。 文件详解...
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历史生物地理学研究_阿拉伯特有蟾蜍谱系的起源与演化
数据集概述 本数据集包含阿拉伯半岛特有蟾蜍谱系历史生物地理学研究的相关文件,涉及系统发育分析的树文件和XML配置文件,用于重建蟾蜍物种的进化关系及推断其生物地理历史,支持对阿拉伯蟾蜍非洲、南亚起源及红海形成等地质事件影响的研究。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式)...
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Basiceros_Based_蚂蚁系统发育分析数据
数据集概述 本数据集为Basiceros属蚂蚁的系统发育分析数据,涉及该属物种的分子与形态学数据。Basiceros属蚂蚁仅分布于新热带区雨林,其自然史信息有限,属内物种系统发育关系未知。数据集通过分子(9个基因)和形态学数据,采用贝叶斯推断(BI)和最大似然(ML)分析,探究物种边界、进化关系及口器形态适应性演化。 文件详解...
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基于系统发育地理学的北美沙漠羚羊松鼠物种分化研究数据
数据集概述 本数据集支持北美沙漠羚羊松鼠(Ammospermophilus属)的系统发育地理分化研究,包含多基因座数据和CO3基因序列数据,以及对应的说明文档。数据用于推断系统发育关系、估算分化时间、分析分布变化及种群动态,共包含4个文件,涵盖DNA序列矩阵及研究方法说明。 文件详解 说明文档类...
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德干王蛇补充资料_5_蛇类系统分类与系统发育分析数据
数据集概述 本数据集为印度蛇类Lycodon deccanensis分类学与系统学研究的补充材料5,核心内容是系统发育分析中使用的细胞色素b(cyt b)基因序列替换模型,用于支持该蛇类的分类学研究与系统发育关系分析。 文件详解 文件名称:oo_486962.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:包含系统发育分析中针对cyt...
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PRKN_FCGR_灵长类基因进化关系分形分析补充数据
数据集概述 本数据集为PRKN基因灵长类进化关系分析的补充材料,包含核苷酸频率统计、分形图形、熵值计算及系统发育树等信息。通过频率混沌游戏法(FCGR)生成分形,结合核苷酸频率、香农熵和树状图,用于研究灵长类PRKN基因的进化关系,支持生物信息学和进化生物学分析。 文件详解 压缩包文件:...
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北美_基于分子标记的入侵蚯蚓种群遗传结构与扩散研究数据
数据集概述 本数据集围绕北美入侵蚯蚓(Lumbricus terrestris、L. rubellus)的扩散机制展开,通过遗传标记分析种群遗传多样性与结构,探究扩散障碍、气候选择及人类活动对其扩散的影响。数据涵盖遗传序列比对、系统发育树、采样位置及遗传方差分析等内容,共包含5个文件。 文件详解 遗传多样性比对文件...
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ERICA_Based_深度学习历史基因渗入推断数据集
数据集概述 本数据集为深度学习方法ERICA的配套数据,用于推断基因组范围的进化关系和局部基因渗入区域。ERICA可处理群体基因组数据和多基因组组装的序列比对,能高效识别不一致的谱系模式和基因组交换区域,已在Heliconius蝴蝶和水稻的真实数据中验证应用。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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NEMBASE4_Based线虫转录组资源功能注释数据
数据集概述 本数据集为线虫转录组资源NEMBASE4的补充数据,包含六十余种线虫(含寄生与自由生活类群)的EST组装转录本、蛋白序列及功能注释信息,支持线虫转录组比较分析、寄生表型相关基因鉴定等研究,含补充信息压缩包与说明文档。 文件详解 Supplementary_Information.zip 文件格式:ZIP...
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BDJ_2016_德国外来入侵昆虫新种K2P比较补充数据
数据集概述 本数据集为生物多样性数据期刊2016年发表的论文补充材料4,包含德国外来入侵昆虫新种Ctenosciara alexanderkoenigi的K2P(Kimura 2-parameter)比较数据,对应BIN编号AAH3983,用于支持该新种的分子分类学研究验证。 文件详解 文件名称:oo_74311.xlsx 文件格式:XLSX...
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Dryad_GOLDEN_北美鹊鸭遗传结构与基因流研究数据
数据集概述 本数据集为研究北美两种鹊鸭(巴罗鹊鸭和普通鹊鸭)种群遗传结构与连通性的相关数据,包含微卫星标记和ddRAD-seq两种标记类型的分析数据,涉及229个微卫星样本和61个ddRAD-seq样本,用于揭示物种遗传结构、基因流及进化关系,为物种保护与管理提供依据。 文件详解 文件名称:GOLDEN.Dryad.zip 文件格式:ZIP...
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ProcRoySocB_海洋松杂合度_适合度相关性研究数据
数据集概述 本数据集围绕海洋松(Pinus pinaster Ait.)的杂合度-适合度相关性(HFCs)展开,通过6100个全基因组单核苷酸多态性(SNPs),在4个环境条件对比的公共试验园(共16288棵树)中验证一般效应和局部效应HFCs,以存活作为适合度指标,探讨近亲繁殖、遗传多样性与进化的关系。 文件详解...
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血液寄生虫_基于Mascarene群岛的遗传多样性研究数据
数据集概述 本数据集围绕Mascarene群岛鸟类感染的疟原虫(Plasmodium)和白细胞虫(Leucocytozoon)两类血液寄生虫展开,通过遗传数据对比两者的群岛内多样性差异,探究殖民化时间、次数及多样化速率对寄生虫多样性模式的影响,揭示历史偶然性对岛屿鸟类血液寄生虫生物地理格局的驱动作用。 文件详解 文件名称:Genetic...
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Carex_Based_苔草属DNA序列系统发育研究补充数据
数据集概述 本数据集为苔草属(Carex)首个大规模系统发育研究的补充数据,基于996个物种(占公认物种的50.23%)的ITS、ETS和matK三个DNA区域序列构建超级矩阵。数据包含系统发育树、DNA序列文件及分类单元列表,支持对苔草属早期分化结构、分类单元单系性的分析,挑战部分传统进化假说。 文件详解 系统发育树文件...
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Uberon_Based_解剖实体进化同源性注释数据v0_2
数据集概述 本数据集为解剖相似性注释数据v0.2,用于定义UBERON本体中解剖实体的进化关系,聚焦历史同源性概念,即捕获源于共同祖先结构的解剖结构关系。注释遵循类似基因本体联盟的指南记录证据线,每条同源性陈述为单一注释,包含参考、解剖实体术语、祖先分类单元、证据类型及置信度信息。 文件详解 文件名称:anatomical-similarity-...
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Loricarioidei_基于进化研究_鲶鱼躯干牙组织数据
数据集概述 本数据集聚焦鲶鱼(尤其是Loricarioidei类群)躯干牙组织(odontodes)的进化研究,包含系统发育分析相关的基因序列、比对文件、进化树及序列信息表,用于探究躯干牙组织与真皮骨板的进化关系及牙组织形成机制。 文件详解 文件名称:Trees.tar 文件格式:TAR...
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环境微生物学补充材料1_黑海厌氧系统微生物脂质生产者研究数据
数据集概述 本数据集为论文《Discovering hidden archaeal and bacterial lipid producers in a euxinic marine system》的补充材料,包含表格、图表、系统发育树等7个文件,覆盖黑海 euxinic 海洋系统中微生物脂质生产者的相关数据,支持对该环境中潜在微生物类群的研究。...
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Sturgeon_Based_鲟鱼保护基因组学SNP标记数据
数据集概述 本数据集为鲟鱼保护基因组学研究的SNP标记数据,通过RAD测序技术对四种鲟鱼(Adriatic、Russian、Persian、Siberian)进行SNP标记发现与验证,包含候选SNP标记信息及相关说明文档,共2个文件,用于鲟鱼物种、种群及个体水平的遗传鉴定与保护管理。 文件详解...



