-
Color_vision_Based南美胎生鱼类种群视觉系统差异研究数据
数据集概述 本数据集围绕南美三种胎生鱼类（孔雀鱼及近缘种）的视觉系统展开研究，通过视蛋白基因表达测量，分析种群间与物种间的视觉差异，为感官偏好进化模型提供数据支持。数据集包含4个文件，涵盖实验数据、分析代码及样本记录。 文件详解 GuySymPropOps.csv 文件格式：CSV...
-
MEC_Letsch_Based蜻蜓系统发育与栖息地分化研究数据2016
数据集概述 本数据集围绕蜻蜓（Anisoptera: Odonata: Insecta）的系统发育与栖息地分化展开，基于8个核基因和线粒体基因，通过模型进化框架分析栖息地使用对分化模式的影响。数据包含序列比对文件及分区方案，用于研究蜻蜓从流水（lotic）到静水（lentic）栖息地的独立殖民化过程，以及栖息地对物种形成速率的影响。 文件详解...
-
NCBI_GenBank_Based_红藻源复杂质体进化模型与定年研究数据
数据集概述 本数据集为红藻源复杂质体进化模型与定年研究的支撑数据，包含经处理的蛋白质序列比对文件、原始序列文件及物种-蛋白质对应矩阵。数据选取自NCBI RefSeq和GenBank数据库，涵盖112种生物的97个保守质体编码蛋白氨基酸序列，用于系统发育和分子钟分析。 文件详解 序列比对文件包（SequenceAlignments.zip）...
-
Perez_etal_2016_Based_南美仙人掌物种多样化模型分析数据
数据集概述 本数据集包含南美仙人掌物种Pilosocereus machrisii和P. aurisetus的多样化分析模型数据，用于验证间冰期避难所假说与长距离扩散事件对物种分化的影响。数据通过近似贝叶斯计算（ABC）方法，结合叶绿体DNA和微卫星位点分子数据，测试物种分化的主要驱动因素，支持避难所模型在物种多样化中的作用。 文件详解...
-
Aspidoscelis_线粒体基因组_鞭尾蜥蜴孤雌生殖氨基酸替代率研究数据
数据集概述 本数据集围绕鞭尾蜥蜴属孤雌生殖与有性生殖物种的线粒体基因组展开研究，通过分析七种孤雌生殖和五种有性生殖物种的全线粒体基因组，验证孤雌生殖导致非同义替代积累的假设。数据集包含基因序列比对、进化模型文件等66个文件，用于支持dN/dS比率估算及相关进化分析。 文件详解 基因序列比对文件 格式：.fasta、.mdsx、.phy...
-
Culex_pipiens_ace_1_Based异质基因复制进化动态研究数据
数据集概述 本数据集围绕库蚊ace-1基因座的异质基因复制展开研究，包含基因进化动态分析所需的完整数据与分析脚本。数据涵盖ace-1等位基因多样性分析、适应度测量及进化模型模拟，通过种群遗传学方法揭示异质复制在环境、亚致死性与互补作用间的平衡机制，为理解基因复制的进化命运提供实证支持。 文件详解 分析脚本文件...
-
Drosophila_orphan_genes_生命周期研究数据_论文补充文件
数据集概述 本数据集为论文《The life cycle of Drosophila orphan genes》的补充文件，聚焦果蝇孤儿基因的生命周期研究，包含果蝇伪暗果蝇（D. pseudoobscura）基因注释的各类特征，涉及孤儿基因的出现、丢失模式及保留相关的表达特征等内容，共包含两个文件。 文件详解...
-
Aquarius_remigis_水黾雄性社会可塑性对交配系统转换影响研究数据
数据集概述 本数据集围绕流溪水黾（Aquarius remigis）交配系统动态展开，聚焦雄性社会可塑性等个体及群体性状对交配系统转换速度的影响。数据记录了水黾群体从多雄交配向单雄垄断交配系统转换的过程，用于探究表型组成与系统转换时机、概率的关联，核心验证雄性平均社会可塑性对单雄主导交配系统出现时间的作用。 文件详解 Stability.xlsx...
-
Andersonetal2014_Based螳螂虾捕食附肢机械系统进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕螳螂虾超快捕食附肢的耦合四连杆与杠杆系统展开，探究生物力学系统的协同进化模式。通过分析“粉碎型”（锤状附肢）和“穿刺型”（ blade状附肢）两类螳螂虾的特征进化模型，验证耦合机械系统的功能放大规律，为生物力学冗余与协同进化研究提供数据支持。 文件详解 文件名称：Andersonetal2014_data.xlsx...
-
Ranitomeya_imitator_Based_拟态分化与物种形成连续体研究数据
数据集概述 本数据集围绕模仿箭毒蛙（Ranitomeya imitator）的拟态分化与物种形成连续体展开，包含两种拟态过渡带（带状-条纹、斑点-条纹）的表型、基因、行为数据及模型分析文件，覆盖表型分化、遗传差异、配偶选择等维度，为研究物种形成过程提供多层面支撑。 文件详解 拟态表型数据文件 文件名称：banded-striped color-...
-
phylocurve_Package_Based_高维系统发育比较模型参数估计数据
数据集概述 本数据集为高维系统发育比较模型参数估计相关数据，聚焦距离法在高维性状进化研究中的局限性，提出基于参数自举和最大伪似然估计的替代方法，支持复杂进化模型参数估计、多假设结合等功能，相关方法已实现于R包phylocurve，数据集包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：sim_scripts.zip 文件格式：ZIP...
-
Phasmid_Wings_Evolution_竹节虫翅膀进化可逆性宏进化分析数据集
数据集概述 本数据集为竹节虫翅膀进化可逆性的宏进化分析研究提供支持，包含超300种竹节虫的基因序列、系统发育树、性状数据及分析文件。数据用于探究复杂性状（翅膀）在进化中丢失后重新获得的可能性，揭示翅膀进化的动态可逆过程，支持物种分化速率与性状进化关系的研究。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式，共8个） 12s.fasta：12S基因序列比对文件...
-
Dryad_DataShared_濒危Socorro等足类自相残杀行为交互表型研究数据
数据集概述 本数据集聚焦濒危物种Socorro等足类（Thermosphaeroma thermophilum）的自相残杀行为，从交互表型视角探究社会伙伴对自相残杀前攻击行为的影响，分析相对体型、伙伴性别等因素的作用，为该物种的行为生态研究提供支持。 文件详解 README_for_dryad data sharing.txt 文件格式：TXT...
-
Extended_haplodiploidy_hypothesis_利他行为进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕扩展单倍二倍体假说展开，探讨利他行为在达尔文进化逻辑中的演化机制，分析种群性别比例、利他成本和种群增长率对单倍二倍体生物（如膜翅目）雌性利他行为演化的影响，重新评估单倍二倍体在利他行为进化中的作用。 文件详解 README_for_Simulations.docx 文件格式：DOCX...
-
Evolution_DeCasien_et_al_哺乳动物脑化与寿命进化相关性研究补充数据
数据集概述 本数据集是研究论文的补充数据，聚焦哺乳动物脑化程度与寿命的进化相关性。研究对比了六个哺乳动物目的独立及相关进化模型，发现灵长类、啮齿类及其父支系Euarchontoglires存在脑化与寿命的相关进化，而其他类群为独立进化，为理解不同类群的进化机制提供数据支持。 文件详解 文件名称：Evolution_DeCasien et...
-
BioGeoBEARS补充材料2_非洲蝴蝶属Mylothris系统演化分析数据_2020年
数据集概述 本数据集为非洲蝴蝶属Mylothris系统演化研究的补充材料，包含用于BioGeoBEARS分析的标量矩阵数据。数据源自2020年发表的学术论文，支持对该属蝴蝶的系统分类与演化关系研究，共包含一个文件。 文件详解 文件名称：oo_379335.xlsx 文件格式：XLSX...
-
Hybridization_Detection_Based_基因树额外谱系似然计算模型数据
数据集概述 本数据集围绕基因树与物种树不一致的检测方法展开，聚焦于在存在不完全谱系分选（ILS）的情况下，通过额外谱系数量的似然计算来检测杂交事件。提供了相关R函数、解释说明及教程，可用于模拟基因树、评估不同基因流水平模型的似然性，以识别物种间的基因流。 文件详解 README_for_supplementary.txt 文件格式：TXT...
-
Archer_et_al_Data_Archive_雌雄健康生存悖论_基因座内性冲突研究数据
数据集概述 本数据集围绕“雌雄健康生存悖论”展开，聚焦基因座内性冲突对该悖论的解释机制。通过进化模型框架验证：群体中分离的等位基因若在雌性繁殖停止后表达，可能对雄性适合度有晚期正向作用，但对雌性健康有负向影响。同时提供果蝇实验数据支持该冲突解决方案，包含1个文件。 文件详解 文件名称：Data_Archive_Archer_et_al.xlsx...
-
Penalized_Likelihood_Based_高维系统发育比较方法及新世界猴脑进化应用数据
数据集概述 本数据集围绕高维系统发育比较方法展开，包含惩罚似然框架的理论方法及应用案例。框架用于解决高维性状（p）接近或超过物种数量（n）时的参数估计与模型比较问题，支持BM、EB、OU等进化模型分析。应用案例以新世界猴脑形态三维数据为例，验证方法有效性，数据集含补充材料与代码文件。 文件详解 补充材料文件...
-
Supplementary_Information_白垩纪晚期鸟脚类恐龙牙齿微磨痕纹理分析研究数据
数据集概述 本数据集是“牙齿微磨痕纹理分析揭示白垩纪晚期鸟脚类恐龙可能存在饮食转变”研究的补充信息，包含19个数据集和95个sur格式文件。数据集涵盖牙齿微磨痕纹理参数、统计分析结果、主成分分析数据、进化模型拟合贝叶斯因子及系统发育树；sur文件为通过VK-9700激光显微镜扫描的恐龙牙齿化石表面原始3D数据，可用于古生物饮食习性研究。 文件详解...
