数据集概述
本数据集包含南美仙人掌物种Pilosocereus machrisii和P. aurisetus的多样化分析模型数据，用于验证间冰期避难所假说与长距离扩散事件对物种分化的影响。数据通过近似贝叶斯计算（ABC）方法，结合叶绿体DNA和微卫星位点分子数据，测试物种分化的主要驱动因素，支持避难所模型在物种多样化中的作用。
文件详解
- 文档文件（.txt格式，共6个）
- 文件名称：README_for_runPPC_Pmac.txt、README_for_runPPC_Paur.txt、README_for_runms_Pmac.txt、README_for_runms_Paur.txt、README_for_Perez_etal_2016_Pilosocereus.txt、README_for_microsat2arp.txt
- 内容：说明用于ABC模型选择和后验预测检查（PPC）分析的脚本，以及微卫星数据处理方法的文档。
- 代码文件（.py格式，共5个）
- 文件名称：microsat2arp.py、runPPC_Pmac.py、runPPC_Paur.py、runms_Pmac.py、runms_Paur.py
- 内容：runms_Paur.py和runms_Pmac.py用于模拟tau、theta、迁徙率、瓶颈效应等参数，输出7种模型下cpDNA和SSR标记的模拟结果；runPPC系列脚本用于后验预测检查；microsat2arp.py用于微卫星数据处理。
- 数据文件（.xlsx格式，共1个）
- 文件名称：Perez_etal_2016_Pilosocereus.xlsx
- 内容：包含用于物种多样化分析的核心数据，支持ABC模型选择和验证。
数据来源
论文“Model-based analysis supports interglacial refugia over long-dispersal events in the diversification of two South American cactus species”
适用场景
- 植物进化生物学研究: 分析南美仙人掌物种的分化机制，验证间冰期避难所对物种多样化的影响。
- 分子生态学分析: 利用叶绿体DNA和微卫星位点数据，研究物种的遗传结构与分化历史。
- 生物地理学模型验证: 测试间冰期避难所假说与长距离扩散事件在物种分布格局形成中的作用。
- 近似贝叶斯计算（ABC）方法应用: 作为ABC模型选择和后验预测检查的案例数据，支持进化模型的参数估计与验证。
