找到139个数据集

标签: 分子进化研究

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  • 黄猴花基因拷贝数变异表型适应性研究数据

    2026年2月10日 30 119 39

    数据集概述 本数据集记录了黄猴花(Mimulus guttatus)tRNA连接酶基因RLG1a的拷贝数变异(CNV)信息,以及该变异与表型(如物候期)和适应性的关联数据。数据支持研究CNV在野生种群遗传多样性中的作用,以及其对植物响应环境压力的调控机制。 文件详解 文件名称:N2091genphendata.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 转座子防御_真菌王国_遗传因素_支持性数据

    2026年2月1日 30 96 41

    数据集概述 本数据集为真菌界转座子防御系统遗传因素系统筛选研究的支持信息,包含15张补充表格,覆盖1239个真菌基因组组装的元数据、重复序列分析、系统发育信号、基因共线性、蛋白质结构域、k-mer频率及关联映射等核心内容,用于解析真菌转座子防御系统的遗传基础。 文件详解 代码文件 文件名称:kmer_analysis.py 文件格式:.py...
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  • PE_dRAD_九刺鱼分子进化与种群基因组分析数据集

    2026年2月9日 30 117 56

    数据集概述 本数据集基于改良的双酶切限制位点相关DNA(PE dRAD)技术,对来自海洋、湖泊和池塘环境的8个九刺鱼种群进行基因组分析,包含114,000余个短共识序列和15,000余个单核苷酸多态性位点(SNPs),可用于研究其适应性进化、种群分化及基因组选择模式,共含26个文件。 文件详解 说明文档(README文件)...
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  • Phylogeny_序列数据_系统发育树构建与残基保守性分析

    2026年2月8日 30 130 99

    数据集概述 本数据集包含用于系统发育树构建与残基保守性分析的序列数据,旨在为分子进化研究提供基础序列信息,支持相关生物信息学分析工作。数据集仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:Sequences_for_Phylogeny.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:文件内容为用于系统发育树构建与残基保守性分析的序列数据,具体字段信息未提供详细预览。...
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  • Spiny_mouse_多刺鼠转录本BLASTx注释数据

    2026年1月30日 30 72 38

    数据集概述 本数据集包含多刺鼠转录本的注释信息,基于BLASTx分析结果整合而成。内容涵盖转录本ID、Corset聚类ID、BLASTx比对参数及结果、UniProtKB登录号、UniProt ID、基因名称和蛋白质名称等核心信息,为多刺鼠转录组学研究提供结构化注释参考。 文件详解...
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  • 被子植物_分子进化速率与多样化速率分析数据

    2026年2月2日 30 138 5

    数据集概述 本数据集支持被子植物年代测定研究,探讨分子数据显示的三叠纪起源与化石记录早白垩世出现的时间差异。通过模拟分析分子进化速率变化和分类群采样策略对年代估计的影响,为理解生物类群年代测定争议提供数据基础。 文件详解 压缩数据文件 文件名称:data.zip 文件格式:ZIP...
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  • 麦克罗莫特蒂克斯科属线粒体基因组补充材料1

    2026年2月1日 30 23 17

    数据集概述 本数据集为ZooKeys期刊论文的补充材料1,包含蚱科(Tetrigidae)37个物种的线粒体基因组比较数据,以及蚱科线粒体基因组蛋白质编码基因(PCGs)的起始和终止密码子信息,用于支持Macromotettixoides属的首次线粒体基因组特征分析及两个新物种的描述研究。 文件详解 文件名称:oo_1001330.docx...
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  • Daphnia_longispina基因结构研究数据

    2026年1月31日 30 1 0

    数据集概述 本数据集记录比利牛斯山高山湖泊浮游甲壳动物Daphnia longispina的基因结构,用于研究末次冰盛期后建立者效应与扩散迁移对基因多样性的影响。数据显示该物种基因结构由单一殖民事件塑造,核基因多样性从东南向西北递减,线粒体突变率高于常规假设,为小尺度长期建立者效应研究提供支持。 文件详解 文件名称:Ventura-Microsats-...
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  • 补充数据_原核生物中歧化硫酸盐还原的系统发育与演化研究

    2026年1月31日 30 15 12

    数据集概述 本数据集是论文《原核生物异化亚硫酸盐还原系统的系统发育与进化》的补充数据,包含5个文件,涵盖基因组信息、Ka/Ks值原始数据、COG信息、树重建用fasta文件及树文件,用于支持原核生物异化亚硫酸盐还原相关的系统发育与进化分析。 文件详解 Supplementary Data 1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • NCBI_RefSeq_基因组编号系统发育树构建补充数据

    2026年1月30日 30 15 10

    数据集概述 本数据集为补充表格,记录了从NCBI RefSeq数据库下载的所有基因组的登录编号,这些基因组用于构建系统发育树。数据集仅包含一个文件,提供了基因组编号的结构化信息。 文件详解 文件名称:Supplementaty_Table_2.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • GPCR_Based_头足类信号转导进化基因组特征分析数据

    2026年1月30日 30 117 37

    数据集概述 本数据集为头足类GPCR基因家族进化研究相关数据,包含正选择分析、表达分析计算及系统发育分析三类文件,支持探究头足类信号转导进化中GPCR扩张的功能转变,为理解头足类形态和神经创新的分子机制提供数据支撑。 文件详解 正选择分析文件 文件名称:PositiveSelectionAnalysis.zip 文件格式:ZIP...
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  • SystBiol_Based_基因系统发育可靠性识别研究数据

    2026年1月29日 30 44 14

    数据集概述 本数据集围绕基因系统发育可靠性识别展开,聚焦基因树拓扑异质性问题,探讨通过时钟相似性、后验预测效应量(PPES)及进化速率过滤基因对系统发育可靠性的影响,包含研究相关的补充文档与代码文件。 文件详解 文档文件 文件名称:Doyle_etal_SystBiol_SuppInfo.docx 文件格式:DOCX...
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  • DRYAD_Based_人类黑猩猩及其虱子基因组分化率研究数据

    2026年1月28日 30 179 94

    数据集概述 本数据集聚焦人类、黑猩猩及其体外寄生虱子的基因组分化率研究,通过对比三者1534个蛋白编码同源基因的DNA序列分化率,发现虱子的DNA替代率平均为人类和黑猩猩的14倍,且基因间替代率呈正相关,该相关性仅存在于改变氨基酸的替代中,提示功能约束的相似性。 文件详解 压缩文件 文件名称:ALIGNMENTS_DRYAD.zip 文件格式:ZIP...
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  • GenBank_Based_家养动物线粒体基因组数据质量评估数据

    2026年1月28日 30 121 4

    数据集概述 本数据集围绕8种常见家养动物(牛、狗、山羊、马、猪、绵羊、牦牛、鸡)及其近缘野生动物的线粒体DNA(mtDNA)序列展开,包含GenBank中已存的1000余条完整或近完整序列,通过系统发育调查评估其数据质量,揭示序列中存在的人工重组、突变冗余等问题。 文件详解 文件名称:pairwise_alignment.zip 文件格式:ZIP...
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  • 基因表达与宿主_寄生虫相互作用_蚂蚁行为与寿命调控的分子机制数据

    2026年1月28日 30 16 3

    数据集概述 本数据集聚焦寄生虫诱导宿主表型改变的分子机制,对比被绦虫Anomotaenia brevis寄生的Temnothorax nylanderi蚂蚁工蚁、未寄生巢友及未寄生蚁群工蚁的脑基因表达模式,识别出400余个差异表达基因,涉及寿命延长、肌肉功能下调等表型相关机制,为寄生虫操纵宿主行为与生活史的近端机制研究提供基因表达与形态测量数据。...
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  • DRYAD_Source_蜂鸟甜味感知进化与鲜味受体转化研究数据集

    2026年1月27日 30 140 39

    数据集概述 本数据集围绕蜂鸟甜味感知进化机制展开,聚焦其祖先鲜味受体(T1R1-T1R3异二聚体)向碳水化合物受体的转化过程。数据包含受体基因序列比对文件与实验分析表格,支撑蜂鸟味觉受体功能改变促进物种辐射的研究结论,共8个文件。 文件详解 序列比对文件(.fasta格式,共4个)...
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  • HGT_CYS_Based_鳞翅目昆虫半胱氨酸合酶基因功能分化研究数据

    2026年1月26日 30 137 106

    数据集概述 本数据集聚焦鳞翅目昆虫中水平转移(HGT)获得的半胱氨酸合酶(CYS)基因的功能分化研究,包含qPCR原始数据,用于分析HGT后基因复制的进化命运、表达模式差异及酶学特性分化,为理解昆虫适应不同食性的分子机制提供基础数据。 文件详解 文件名称:qPCR_raw_data.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Common_Ancestry_Based_灵长类共同祖先统计证据研究数据

    2026年1月21日 30 38 15

    数据集概述 本数据集为论文“Statistical evidence for common ancestry: application to...
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  • Pasteuria_Daphnia_Based宿主基因组进化研究数据

    2026年1月26日 30 157 40

    数据集概述 本数据集用于研究寄生虫驱动宿主基因组进化的分子机制,聚焦浮游甲壳动物大型溞(Daphnia magna)与细菌病原体Pasteuria ramosa的互作系统。包含97个欧洲来源Daphnia magna基因型的全基因组多态性数据,通过关联分析识别抗P. ramosa的基因组区域,并检测正选择信号。数据集共3个文件,支持宿主-...
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  • ZooKeys_补充材料_5_虹吸螺科物种的PCGs_RSCU值数据

    2026年1月23日 30 104 21

    数据集概述 本数据集为论文《日本石磺(Heterobranchia,Siphonariidae)的完整线粒体基因组及其系统发育意义》的补充材料5,包含Siphonariidae科物种完整蛋白质编码基因(PCGs)的相对同义密码子使用度(RSCU)值数据,用于支持线粒体基因组的系统发育分析。 文件详解 文件名称:oo_1346638.xlsx...
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