数据集概述
本数据集用于研究寄生虫驱动宿主基因组进化的分子机制，聚焦浮游甲壳动物大型溞（Daphnia magna）与细菌病原体Pasteuria ramosa的互作系统。包含97个欧洲来源Daphnia magna基因型的全基因组多态性数据，通过关联分析识别抗P. ramosa的基因组区域，并检测正选择信号。数据集共3个文件，支持宿主-寄生虫互作的分子进化研究。
文件详解
- Resistotypes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：推测包含Daphnia magna各基因型对Pasteuria ramosa的抗性表型数据（如抗性/易感分类），用于关联分析的表型输入
- scaffold1036_supp.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍： scaffold1036区域的基因组变异数据，包含该区域内的单核苷酸多态性（SNP）或插入缺失（InDel）信息，可能对应已知的抗性相关QTL区域
- Input_vcf.recode.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：全基因组范围的变异数据，包含97个Daphnia magna基因型的基因组多态性信息，用于全基因组关联分析和选择信号检测
适用场景
- 宿主-寄生虫互作分子机制研究：分析Daphnia magna抗Pasteuria ramosa的基因组区域，解析抗性进化的分子基础
- 基因组选择信号检测：通过全基因组扫描识别受正选择的区域，验证寄生虫驱动宿主基因组进化的假设
- 关联分析方法验证：利用已知抗性QTL区域数据，验证关联分析在宿主抗性基因定位中的有效性
- 进化生物学研究：探究宿主-病原体共进化过程中基因组的动态变化规律
