数据集概述
本数据集围绕8种常见家养动物（牛、狗、山羊、马、猪、绵羊、牦牛、鸡）及其近缘野生动物的线粒体DNA（mtDNA）序列展开，包含GenBank中已存的1000余条完整或近完整序列，通过系统发育调查评估其数据质量，揭示序列中存在的人工重组、突变冗余等问题。
文件详解
- 文件名称：pairwise_alignment.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含家养动物与近缘野生动物线粒体DNA序列的比对数据，具体字段需解压后查看原始比对文件内容，推测包含物种分类、序列ID、碱基比对结果等核心信息。
数据来源
论文“Mitochondrial genomes of domestic animals need scrutiny”
适用场景
- 线粒体基因组数据质量控制研究: 分析家养动物mtDNA序列中的人工误差类型及比例，优化序列数据筛选标准。
- 家养动物系统发育研究: 基于高质量mtDNA序列构建系统发育树，探究家养动物与野生动物的亲缘关系。
- 生物信息学数据评估: 为GenBank等公共数据库中动物线粒体序列的质量审核提供参考依据。
- 分子进化研究: 利用可靠的mtDNA序列分析家养动物线粒体基因组的进化模式与突变特征。
