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Lemonade_Creek_YNP_Based_地热泉嗜极红藻垫病毒分类单元与基因组数据集
数据集概述 本数据集包含美国黄石国家公园Lemonade Creek地热泉环境中的病毒操作分类单元（vOTUs）和病毒宏基因组组装基因组（vMAGs），源于相关研究论文，反映地热环境病毒与嗜极红藻垫的长期相互作用及古老起源特征。 文件详解 文件名称：All_vMAGs_Newick_phylogenies_revision.zip 文件格式：ZIP...
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Compositae_Target_Enrichment_菊科植物系统发育信息富集方法研究数据
数据集概述 本数据集来自菊科植物系统发育信息靶向富集方法的研究，包含763个基因位点的系统发育数据、序列长度与数量统计、序列比对文件及比对文件压缩包，可用于菊科植物的系统发育分析与亲缘关系重建。 文件详解 系统发育树文件 文件名称：763_loci_tree_newick 文件格式：无扩展名（Newick格式）...
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Pioneering_polyploids_New_Zealand植物多倍体基因组复制研究数据
数据集概述 本数据集围绕新西兰两种木本植物类群（Coprosma和Veronica），探究全基因组复制（WGD）对生物群落迁移的影响。通过分析不同倍性水平物种的生物群落占据情况（森林、开阔地、高山），验证多倍体是否提升生物群落迁移速率。数据集包含30个文件，涵盖代码脚本、倍性数据、模型比较表、系统发育树等，支持相关统计检验与模型分析。 文件详解...
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Lepilemur_mitogenomes_Based运动狐猴系统基因组重建及生物地理学分析数据
数据集概述 本数据集包含35个完整线粒体基因组的分析结果，覆盖运动狐猴属（Lepilemur）全部26个已识别类群，用于系统基因组重建及马达加斯加生物地理学推断。数据支持25个单系谱系的恢复，以及Lepilemur mittermeieri与Lepilemur...
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Neutral_Community_Models_Gene_Flow_系统发育树_物种丰度分布数据
数据集概述 本数据集包含基于中性群落模型模拟生成的系统发育树数据，用于研究基因流对群落系统发育树和物种丰度分布的影响。通过对比带基因流的长期物种形成模型和无基因流的点突变物种形成模型，分析预平衡状态下群落特征与经验数据的一致性。数据集包含2个文件，支持生态系统演化动力学研究。 文件详解 README_for_Data.txt 文件格式：TXT...
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Resurrecting_Ancient_Antibiotics_现代脂肽类抗生素起源研究支持数据
数据集概述 本数据集为论文“Resurrecting Ancient Antibiotics: Unveiling the Origins of Modern Lipid II Targeting Glycopeptides”的支持数据，包含49个文件，涉及系统发育树、序列比对、进化重建概率等内容，用于揭示现代脂肽类抗生素的进化起源与机制。 文件详解...
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Hyla_splendens_Based_Gastrotheca分类学澄清与Bolivian种群挑战数据集
数据集概述 本数据集为论文配套数据，包含用于澄清Hyla splendens物种身份及挑战Bolivian地区Gastrotheca种群分类学的相关信息，涵盖序列数据、系统发育树及地理溯源信息，共3个文件，支持两栖动物分类学研究。 文件详解 文件名称：16S sequences used - Koehler et al Gastrotheca...
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系统发育树文件_Newick格式
数据集概述 本数据集包含以Newick格式存储的系统发育树文件，核心围绕生物学基因相关的进化关系分析，通过压缩包形式提供，便于获取和使用。 文件详解 文件名称: phylogenetic_tree_files.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明:...
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RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415
数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料，包含经实验验证的植物NLR（核苷酸结合寡聚化结构域样受体）相关序列、注释及分析结果，涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据，为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件，具体说明如下： - 补充表格文件: -...
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SARS_CoV_2冠状病毒序列组成复杂性适应性趋势补充数据集
数据集概述 本数据集是论文《SARS-CoV-2冠状病毒大流行期间序列组成复杂性的适应性趋势》的补充数据，包含病毒基因组序列组成复杂性（SCC）分析相关的表格、系统发育树、序列文件等，支持对病毒进化适应性趋势的研究。 文件详解 该数据集包含多个文件和压缩包，具体说明如下： - 补充表格文件: - SupplementaryTables...
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辅助NLR通道细胞器钙触发植物免疫补充数据集
数据集概述 本数据集为《辅助NLR通道细胞器钙触发植物免疫》手稿的补充数据，包含13个文件，涵盖氨基酸序列、钙传感器强度原始数据、系统发育树等内容，支持植物免疫机制相关研究。 文件详解 氨基酸序列与比对文件： Data_S1.zip（压缩包）：NbNRG1与AtNRG1的氨基酸比对数据 Data_S6.fasta（FASTA）：用于系统发育分析的NB-...
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扁甲总科系统发育CAT_GTR模型重新分析数据集
数据集概述 该数据集基于Gimmel等（2019）的数据，使用CAT-GTR+G4位点异质性混合模型对扁甲总科（Cleroidea）的系统发育关系进行重新分析，包含分子分析所需数据及输出文件，关联于特定研究论文。 文件详解 数据文件： cleroidfull.phy：系统发育分析的输入数据文件 分析结果文件：...
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爱琴海群岛物种遗传多样性相关性测试数据集
数据集概述 本数据集围绕爱琴海群岛15个岛屿的拟步甲群落，通过线粒体和核基因序列分析，验证物种多样性与遗传多样性（SGDC）的相关性，探索物种-面积、单倍型-面积关系及群落相似性衰减模式，为中性生物多样性理论提供实证支持。 文件详解 文件名称: AmNat52448_TableA3.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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纤毛虫四膜虫无性生殖多起源研究数据集
数据集概述 本数据集围绕纤毛虫四膜虫无性生殖（无小核型）的起源与进化展开，通过细胞色素氧化酶-1（cox1）条形码和SSU基因分析，探究自然中无小核型四膜虫的系统发育起源、相对年龄及物种多样性，为理解无性生殖在四膜虫中的适应性机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: README_for_SSU amicronucleate tree.pdf...
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哺乳动物多形态钟与全证据端点定年数据集
数据集概述 本数据集围绕哺乳动物多形态钟与全证据端点定年研究，包含形态特征演化时钟分析、系统发育拓扑推断及分歧时间估计相关数据，涉及单时钟与多时钟模型对比及参数收敛、树结构等结果文件。 文件详解 该数据集包含26个文件，具体说明如下： - 文档类文件: - Description.docx: Word文档，可能为研究项目的详细描述 -...
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oggmap_orthomap_Based_基因直系同源分析示例完整数据
数据集概述 本数据集是Python包oggmap/orthomap的示例数据，包含基于不同数据库版本（Ensembl、WormBase等）的OrthoFinder分析结果、物种列表、分类树及预计算的直系同源映射等文件，为基因直系同源分析提供示例数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型的文件，具体说明如下： -...
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巽他_萨赫尔植物区系交换与西南太平洋扩散路径数据集
数据集概述 本数据集围绕巽他-萨赫尔植物区系交换及湿热带森林树木向西南太平洋的扩散路径展开，通过系统发育与生物地理分析，揭示Dysoxylum s.l.属植物的起源、演化及扩散机制，识别西南太平洋的主要扩散路径。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 文档与说明文件: - README.md:...
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江户明樱蛤染色体水平基因组组装数据集
数据集概述 本数据集为江户明樱蛤的染色体水平基因组组装数据，包含基因组序列、基因家族注释、系统发育树等信息，旨在揭示其血红素生物合成的分子基础，为贝类遗传育种与群体遗传学研究提供基因组资源。 文件详解 该数据集包含多个文件，具体说明如下： - 文档与说明文件： - readme.txt：文本格式，提供数据集标题、作者信息等基础说明 -...
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农杆菌系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集为拟议新物种Agrobacterium bohemicum sp. nov.的系统发育分析提供完整数据支持，包含基因组序列、基因文件、系统发育树及相关分析文件，覆盖从原始序列到分析结果的全流程数据。 文件详解 该数据集包含82个文件，具体说明如下： - 基因组序列文件: -...
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蚂蚁系统发育中病毒多样性与协同进化动力学数据集
数据集概述 该数据集包含研究中评估的所有病毒分支的比对文件和系统发育树，以及鉴定出的所有病毒序列的核苷酸序列数据，为分析蚂蚁系统发育中病毒多样性与协同进化动力学提供支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 病毒序列文件: - final_viruses_contigs.fasta:...
