数据集概述
本数据集包含基于中性群落模型模拟生成的系统发育树数据,用于研究基因流对群落系统发育树和物种丰度分布的影响。通过对比带基因流的长期物种形成模型和无基因流的点突变物种形成模型,分析预平衡状态下群落特征与经验数据的一致性。数据集包含2个文件,支持生态系统演化动力学研究。
文件详解
- README_for_Data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据内容为模拟生成的系统发育树(Newick格式),长期物种形成模型数据列包括:模拟ID、物种形成时间、延迟时间、世代数、采样类型(全树、稀有物种修剪、年轻物种修剪、随机修剪)、Newick格式树数据
- Data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含模拟生成的系统发育树数据文件,具体内容需解压后查看
数据来源
论文“Empirical phylogenies and species abundance distributions are consistent with pre-equilibrium dynamics of neutral community models with gene flow”
适用场景
- 中性群落模型验证: 对比带基因流与无基因流模型的群落特征,验证预平衡状态下模型与经验数据的一致性
- 系统发育树结构分析: 利用Newick格式树数据,研究不同采样类型对系统发育树分支模式(如gamma统计量)的影响
- 物种丰度分布研究: 分析模拟群落的物种丰度分布特征,探讨基因流对群落结构的作用机制
- 生态演化动力学模拟: 基于预平衡状态下的群落数据,模拟生态系统的宏观演化过程