找到44个数据集

标签: Newick格式

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  • 数据18S_rRNA_Based_水生真菌栖息地特异性群落参考数据集

    2026年1月23日 30 110 75

    数据集概述 本数据集整合了公开的真菌18S rRNA基因序列与海洋真菌培养物新序列,补充了10类栖息地类型等验证上下文数据,包含系统发育参考树,用于分析水生真菌群落模式、栖息地对群落结构的影响及分类组成差异,为水生真菌研究提供参考。 文件详解 README_for_aquatic_fungal_communities.txt 文件格式:TXT...
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  • Convergence_鱼类BCF波动游泳运动学与形态学比较研究数据集

    2026年1月22日 30 76 75

    数据集概述 本数据集为44种不同鱼类的身体与尾鳍(BCF)波动游泳运动学与形态学比较研究数据,包含运动学参数、形态特征及相关分析文件,揭示传统游泳模式分类与实际运动学特征的差异,支持水生运动机制及仿生机器人研究。 文件详解 数据文件...
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  • Vibrio_T3SS2_Based细菌分泌系统效应蛋白分布研究补充数据集

    2026年1月21日 30 67 20

    数据集概述 本数据集是关于弧菌III型分泌系统2(T3SS2)的研究补充数据,包含T3SS2系统的系统发育树、基因组登录号表、效应蛋白预测表及聚类分析文件,涉及效应蛋白的分布特征与系统进化信息,共6个文件。 文件详解 系统发育树相关文件 文件名称:T3SS2 phylogenetic tree Newick.txt 文件格式:TXT...
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  • Amatitlania_Based_中美洲慈鲷系统地理学与物种界定研究数据

    2026年1月21日 30 109 87

    数据集概述 本数据集聚焦中美洲慈鲷科Amatitlania属的系统地理学模式与物种界定研究,包含318个个体的线粒体DNA序列分析结果,涉及该属全部3个已识别物种的地理分布范围。数据支持将Amatitlania属划分为2个独立物种,并揭示其更新世以来的演化历史,共包含23个相关文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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  • Emberizoidea_Based_新大陆鸟类系统发育与生物地理学研究数据

    2026年1月20日 30 56 12

    数据集概述 本数据集包含新大陆鸟类类群Emberizoidea(涵盖麻雀、主红雀、黑鸟、林莺、唐纳雀等约832种)的近物种水平系统发育树及相关分析文件,是目前该类群最完整(≥95%)的系统发育假说资源,支持生物地理起源、演化动态及生态过程研究。 文件详解 文档类文件(.txt格式,共4个)...
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  • Mammalian_Intestinal_Based哺乳动物肠道异速生长与生态特征研究数据集

    2026年1月17日 30 156 37

    数据集概述 本数据集收集了519种哺乳动物的肠道各段长度、体重数据,以及营养级、气候和其他生物学特征信息,用于验证肠道尺寸与食性、系统发育、气候等因素的关系。数据包含肠道形态测量值、系统发育关系及相关文献参考,可支持哺乳动物消化系统生态学的多维度分析,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:MammalIntestine_Data.xlsx...
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  • Limulus_polyphemus_Based_美洲鲎视蛋白基因组注释与进化分析数据

    2026年1月14日 30 178 138

    数据集概述 本数据集为美洲鲎(Limulus polyphemus)视蛋白基因组研究的相关数据,包含视蛋白基因库的系统发育分析文件、进化树结构文件及 phyloseq 数据库文件,用于支撑美洲鲎视蛋白家族的注释、系统发育关系分析及组织表达模式研究,为理解螯肢动物视蛋白进化及节肢动物视觉系统演化提供数据资源。 文件详解...
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  • Jauhal_et_al_Mol_Ecol_基于须鲸与外类群的嗅觉受体基因进化评估数据

    2026年1月14日 30 23 3

    数据集概述 本数据集围绕须鲸嗅觉受体基因进化评估展开,包含从须鲸及陆生外类群物种中挖掘的嗅觉受体基因序列、系统发育树文件、分析代码及结果可视化文件,共8个文件,支持基因进化相关研究的复现与分析。 文件详解 压缩包文件...
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  • Cnidaria_Microsatellite_刺胞动物门微卫星丰度与系统发育分析数据

    2026年1月14日 30 69 30

    数据集概述 本数据集围绕刺胞动物门(包括珊瑚虫纲和水螅纲)的微卫星丰度展开研究,分析11个物种的微卫星基序分布、系统发育关系及共生/非共生状态对基因组的影响。包含微卫星搜索结果、系统发育树、蛋白质序列及分析说明,共4个文件,支持基因组进化与共生关系研究。 文件详解 README_for_ScirokoResultsAll.rtf 文件格式:RTF...
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  • Borealestes_Based_中生代哺乳动物形態演化與生態多樣性研究數據_2021

    2026年1月13日 30 171 12

    数据集概述 本数据集包含早侏罗世哺乳形类生物Borealestes的后颅骨骼化石相关研究数据,涵盖系统发育分析矩阵、系统发育树文件、地标数据集、现生哺乳动物标本数据表及主成分分析结果等,为研究早期哺乳动物生态形态多样性的起源提供基础数据支撑,共含24个文件。 文件详解 文本文件(.txt)...
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  • LG_Phylogenies_Based_澳大利亚干旱区蜥蜴群落系统发育与物种互作研究数据

    2026年1月12日 30 42 40

    数据集概述 本数据集聚焦澳大利亚干旱区高多样性蜥蜴群落,包含32个采样点的群落调查数据、3个蜥蜴分支(Ctenotus石龙子、鬣蜥科、澳虎亚科壁虎)的物种水平分子系统发育树,以及物种栖息地偏好和食性数据,用于研究系统发育、群落组成与生态位演化的关系。 文件详解 README_for_LG_phylogenies.txt 文件格式:TXT...
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  • Lemonade_Creek_YNP_Based_地热泉嗜极红藻垫病毒分类单元与基因组数据集

    2026年1月12日 30 87 46

    数据集概述 本数据集包含美国黄石国家公园Lemonade Creek地热泉环境中的病毒操作分类单元(vOTUs)和病毒宏基因组组装基因组(vMAGs),源于相关研究论文,反映地热环境病毒与嗜极红藻垫的长期相互作用及古老起源特征。 文件详解 文件名称:All_vMAGs_Newick_phylogenies_revision.zip 文件格式:ZIP...
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  • Compositae_Target_Enrichment_菊科植物系统发育信息富集方法研究数据

    2026年1月11日 30 70 11

    数据集概述 本数据集来自菊科植物系统发育信息靶向富集方法的研究,包含763个基因位点的系统发育数据、序列长度与数量统计、序列比对文件及比对文件压缩包,可用于菊科植物的系统发育分析与亲缘关系重建。 文件详解 系统发育树文件 文件名称:763_loci_tree_newick 文件格式:无扩展名(Newick格式)...
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  • Pioneering_polyploids_New_Zealand植物多倍体基因组复制研究数据

    2026年1月11日 30 15 1

    数据集概述 本数据集围绕新西兰两种木本植物类群(Coprosma和Veronica),探究全基因组复制(WGD)对生物群落迁移的影响。通过分析不同倍性水平物种的生物群落占据情况(森林、开阔地、高山),验证多倍体是否提升生物群落迁移速率。数据集包含30个文件,涵盖代码脚本、倍性数据、模型比较表、系统发育树等,支持相关统计检验与模型分析。 文件详解...
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  • Lepilemur_mitogenomes_Based运动狐猴系统基因组重建及生物地理学分析数据

    2026年1月8日 30 129 86

    数据集概述 本数据集包含35个完整线粒体基因组的分析结果,覆盖运动狐猴属(Lepilemur)全部26个已识别类群,用于系统基因组重建及马达加斯加生物地理学推断。数据支持25个单系谱系的恢复,以及Lepilemur mittermeieri与Lepilemur...
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  • Neutral_Community_Models_Gene_Flow_系统发育树_物种丰度分布数据

    2026年1月7日 30 93 70

    数据集概述 本数据集包含基于中性群落模型模拟生成的系统发育树数据,用于研究基因流对群落系统发育树和物种丰度分布的影响。通过对比带基因流的长期物种形成模型和无基因流的点突变物种形成模型,分析预平衡状态下群落特征与经验数据的一致性。数据集包含2个文件,支持生态系统演化动力学研究。 文件详解 README_for_Data.txt 文件格式:TXT...
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  • Resurrecting_Ancient_Antibiotics_现代脂肽类抗生素起源研究支持数据

    2026年1月7日 30 7 2

    数据集概述 本数据集为论文“Resurrecting Ancient Antibiotics: Unveiling the Origins of Modern Lipid II Targeting Glycopeptides”的支持数据,包含49个文件,涉及系统发育树、序列比对、进化重建概率等内容,用于揭示现代脂肽类抗生素的进化起源与机制。 文件详解...
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  • Hyla_splendens_Based_Gastrotheca分类学澄清与Bolivian种群挑战数据集

    2025年12月30日 30 81 0

    数据集概述 本数据集为论文配套数据,包含用于澄清Hyla splendens物种身份及挑战Bolivian地区Gastrotheca种群分类学的相关信息,涵盖序列数据、系统发育树及地理溯源信息,共3个文件,支持两栖动物分类学研究。 文件详解 文件名称:16S sequences used - Koehler et al Gastrotheca...
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  • 系统发育树文件_Newick格式

    2025年12月19日 30 123 23

    数据集概述 本数据集包含以Newick格式存储的系统发育树文件,核心围绕生物学基因相关的进化关系分析,通过压缩包形式提供,便于获取和使用。 文件详解 文件名称: phylogenetic_tree_files.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 内容说明:...
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  • RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415

    2025年12月23日 30 193 21

    数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料,包含经实验验证的植物NLR(核苷酸结合寡聚化结构域样受体)相关序列、注释及分析结果,涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据,为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件,具体说明如下: - 补充表格文件: -...
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