数据集概述
本数据集是论文“Historical and current environmental selection on functional traits of trees in the Atlantic Forest biodiversity hotspot”的配套数据,包含2122种树木的系统发育树、物种水平功能性状、群落加权均值插值栅格图,以及性状和丰度数据的参考文献与采样信息,共5个文件,支持大西洋森林树木功能性状与环境选择关系的研究。
文件详解
- 物种水平功能性状数据
- 文件名称:Species-level_Trait_Data_Silva_et_al._2021.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含科(family)、属(genus)、种(species)等分类信息,以及比叶面积(specific.leaf.area_mm2.mg-1)、叶干物质含量(leaf.dry.matter_g.g-1)、叶氮含量(leaf.nitrogen_mg.g-1)、叶厚度(leaf.thickness_mm)、木材密度(wood.density_g.cm-3)、最大高度(maximum.height_m)、种子干质量(seed.dry.mass_mg)、生长型(growth.form)等功能性状字段。
- 系统发育树数据
- 文件名称:Phylogenetic_Tree_Silva_et_al._2021.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含2122种树木的系统发育关系,以Newick格式存储,记录物种间的进化分支和分化时间(如Casearia属物种的分支时间为27.118992)。
- 群落加权均值插值栅格图
- 文件名称:CWM_Trait_Maps.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含7个通过普通克里金插值生成的功能性状群落加权均值(CWM)空间连续表面栅格文件,反映大西洋森林区域功能性状的空间分布。
- 丰度数据参考文献
- 文件名称:References-abundance-data.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含各研究站点物种丰度数据的采样细节及参考文献信息,支持数据溯源。
- 性状数据参考文献
- 文件名称:References-trait-data.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含功能性状数据的采样细节及参考文献信息,字段包括性状ID(trait-ID)、性状名称(trait-name)、作者、年份、物种原名(spp-original-name)、经纬度、参考文献标题、出版机构、参考文献类型、参考文献来源等。
数据来源
论文“Historical and current environmental selection on functional traits of trees in the Atlantic Forest biodiversity hotspot”(Journal of Vegetation Science,DOI: 10.1111/jvs.13049)
适用场景
- 功能性状进化分析:利用系统发育树和物种水平性状数据,研究大西洋森林树木功能性状的进化模式与系统发育信号。
- 环境选择压力研究:结合群落加权均值栅格图,分析历史与当前环境因子对树木功能性状的选择压力。
- 生物多样性保护:基于功能性状空间分布,识别大西洋森林生物多样性热点区域的功能多样性特征,为保护策略制定提供支持。
- 生态位分化研究:通过功能性状数据,探究不同树种在资源利用和环境适应上的生态位分化机制。
- 数据整合分析:利用参考文献文件,整合多源性状与丰度数据,开展跨研究的 meta 分析。