数据集概述
本数据集包含新大陆鸟类类群Emberizoidea(涵盖麻雀、主红雀、黑鸟、林莺、唐纳雀等约832种)的近物种水平系统发育树及相关分析文件,是目前该类群最完整(≥95%)的系统发育假说资源,支持生物地理起源、演化动态及生态过程研究。
文件详解
- 文档类文件(.txt格式,共4个)
README_for_Emberizoid_trees.txt:Emberizoid系统发育树文件说明文档
README_for_taxon_translations.txt:分类单元翻译文件说明文档
README_for_emberizoid.supertrees.txt:超级树文件说明文档
taxon_translations.txt:分类单元映射表,包含tree_order(树序号)、tree_taxon(树分类单元)、clements_6_9_sort(分类编号)、clements_category(分类类别)、clements_6_9_name(分类名称)、notes(备注)字段
- 代码文件(.r格式,共1个)
output.posterior.r:系统发育后验分析相关R代码文件
- 压缩包文件(.zip格式,共1个)
Emberizoid_trees.zip:包含6个系统发育树文件的压缩包,含NEXUS和Newick格式的汇总树、4000棵伪后验树等
- 数据文件(.rdata格式,共1个)
emberizoid.supertrees.RData:Emberizoidea超级树R数据文件
数据来源
论文“New insights into New World biogeography: an integrated view from the phylogeny of blackbirds, cardinals, sparrows, tanagers, warblers, and allies”
适用场景
- 生物地理学研究:分析Emberizoidea类群的新大陆起源、扩散路径及时序
- 进化生物学分析:基于系统发育树探究类群演化动态、分化时间及亲缘关系
- 生态过程解析:结合生物地理数据研究生态系统中线系的生态适应机制
- 分类学验证:验证Mayr关于新大陆鸟类区系起源的推测,解决部分类群大陆起源的歧义
- 跨学科研究:为演化生态学、保护生物学等领域提供基础系统发育资源