数据集概述
本数据集为论文“Repression precedes independent evolutionary gains of a highly specific gene expression pattern”的配套数据，包含系统发育树文件、基因位点文档、序列比对及分区文件等，共5个文件，用于支持基因表达模式进化机制的研究。
文件详解
- 文件名称：tree_nexus_rooted（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名（推测为Nexus格式系统发育树文件）
- 字段映射介绍：包含有根的系统发育树信息，用于展示物种或基因的进化关系。
- 文件名称：tree_newick_rooted（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名（推测为Newick格式系统发育树文件）
- 字段映射介绍：包含有根的系统发育树信息，用于进化关系的可视化与分析。
- 文件名称：SleB1-putative Abd-B sites.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：记录SleB1基因中推测的Abd-B结合位点相关信息，可能包括位点位置、序列特征等内容。
- 文件名称：alignment_partition.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：定义多基因序列比对的分区信息，包含7个基因（28S、Adh、COI、COII、Amyrel、Ddc、Dll、e、en、eve）的序列位置范围，如“gene_28S = 1-848”表示28S基因对应比对序列的1至848位。
- 文件名称：alignment_nt（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名（推测为核苷酸序列比对文件）
- 字段映射介绍：包含多个基因的核苷酸序列比对数据，是进化分析的核心原始数据。
数据来源
论文“Repression precedes independent evolutionary gains of a highly specific gene expression pattern”
适用场景
- 进化生物学研究：分析基因表达模式的独立进化获得机制，验证“抑制先于进化获得”的假说。
- 系统发育分析：利用有根的系统发育树文件，研究物种或基因家族的进化关系。
- 基因调控位点研究：通过SleB1基因的Abd-B结合位点信息，探究基因表达的调控机制。
- 分子进化分析：结合序列比对及分区文件，开展基因序列的进化速率、选择压力等分析。
- 比较基因组学：整合多基因序列数据，进行不同物种间的基因组特征比较与功能注释。
