数据集概述
本数据集是关于弧菌III型分泌系统2（T3SS2）的研究补充数据，包含T3SS2系统的系统发育树、基因组登录号表、效应蛋白预测表及聚类分析文件，涉及效应蛋白的分布特征与系统进化信息，共6个文件。
文件详解
- 系统发育树相关文件
- 文件名称：T3SS2 phylogenetic tree Newick.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含T3SS2重建的系统发育树Newick格式数据，记录不同菌株的进化分支关系及分支长度
- 文件名称：Concatenated sequences of 1338 y 1339 with rhiz outliers.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含1338和1339序列（含根际异常值）的串联序列数据，用于系统发育树构建
- 基因组与效应蛋白信息表
- 文件名称：Table S1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录基因组登录号等相关信息
- 文件名称：Table S2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含新型效应蛋白的预测数据
- 文件名称：Table S3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录T3SS2相关组件的有无状态数据
- 聚类分析文件
- 文件名称：Morpheus T3SS2 analysis.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：来自MORPHEUS的层次聚类数据分析结果文件
数据来源
论文“The Vibrio Type III Secretion System 2 is not restricted to the Vibrionaceae and encodes differentially distributed repertoires of effector proteins”
适用场景
- 细菌分泌系统进化研究: 利用系统发育树数据分析T3SS2系统在不同菌株中的进化关系
- 效应蛋白分布特征分析: 通过效应蛋白预测表与分布数据，研究T3SS2效应蛋白的差异分布规律
- 基因组信息关联研究: 结合基因组登录号表，关联T3SS2系统与菌株基因组的对应关系
- 生物信息聚类分析: 使用MORPHEUS聚类数据，分析T3SS2相关组件的聚类特征
