数据集概述
本数据集来自菊科植物系统发育信息靶向富集方法的研究，包含763个基因位点的系统发育数据、序列长度与数量统计、序列比对文件及比对文件压缩包，可用于菊科植物的系统发育分析与亲缘关系重建。
文件详解
- 系统发育树文件
- 文件名称：763_loci_tree_newick
- 文件格式：无扩展名（Newick格式）
- 字段映射介绍：存储基于763个基因位点构建的系统发育树结构信息
- 序列统计文件
- 文件名称：COS_sequence_length&number_of_sequences.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含菊科植物保守直系同源序列（COS）的长度和序列数量统计信息
- 序列比对文件
- 文件名称：Concatenation_of_all_763_COS_alignments_NEW.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：763个保守直系同源序列的联合比对结果，包含序列ID和比对后的核苷酸序列
- 比对文件压缩包
- 文件名称：COS_alignment_files_NEW.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩存储多个保守直系同源序列的单独比对文件
数据来源
论文“A target enrichment method for gathering phylogenetic information from hundreds of loci: an example from the Compositae”
适用场景
- 菊科植物系统发育分析: 利用系统发育树文件和序列比对数据重建菊科植物的亲缘关系
- 植物基因组靶向富集方法验证: 评估靶向富集技术在菊科植物系统发育研究中的应用效果
- 保守基因位点分析: 通过序列统计文件研究菊科植物保守直系同源序列的特征
- 植物分子进化研究: 基于序列比对数据分析菊科植物基因的分子进化模式与速率
